文献类型：期刊文章

作　　者：罗静初[1,2]

LUO Jingchu(College of Life Sciences and Center for Bioinformatics,Peking University,Beijing 100871,China)

机构地区：[1]北京大学生命科学学院,北京100871 [2]北京大学生物信息中心,北京100871

出　　处：《生物信息学》

年　　份：2021

卷　　号：17

期　　号：1

起止页码：1-25

语　　种：中文

收录情况：ZGKJHX、普通刊

摘　　要：本文介绍欧洲分子生物学开放软件包EMBOSS序列分析程序应用实例。第1节简单介绍EMBOSS软件包的概况和基本用法。第2节介绍格式转换、序列提取、序列变换和序列显示等常用序列处理程序。第3节介绍序列比对程序,包括双序列比对、多序列比对和点阵图程序。第4节介绍常用核酸序列分析程序,可用于核苷酸组分统计、开放读码框分析、CpG岛识别、密码子使用统计和重复序列寻找等。第5节介绍常用蛋白质序列分析程序,包括氨基酸组分统计、序列特征位点识别、二级结构分析等。文中结合教学实例,选择部分常用程序,给出具体运行方式,并扼要说明分析结果的生物学意义。文末对程序运行过程中需要注意的地方加以讨论,并用表格列出部分常用程序的名称和用途,以便读者查阅。

关 键 词：EMBOSS软件包  双序列比对 多序列比对 点阵图 核酸序列分析 蛋白质序列分析

分 类 号：Q349+.53]