文献类型：期刊文章

作　　者：罗亚林[1] 魏玲[2] 姬艳丽[2] 罗广平[2] 付涌水[1,2] 温机智[2] 黎诚耀[1]

LUO Ya-lin;WEI Ling;JI Yan-li;LUO Guang-ping;FU Yong-shui;WEN Ji-zhi;LI Cheng-yao(Department of Transfusion Medicine,Southern Medical University,Guangzhou 510515,China;Institute of Clinical Blood Transfusion,Guangzhou Blood Center,Guangzhou,510095,China)

机构地区：[1]南方医科大学检验与生物技术学院输血医学系,广东广州510515 [2]广州血液中心临床输血研究所,广东广州510095

出　　处：《中山大学学报（医学科学版）》

基　　金：国家自然科学基金(81900184)。

年　　份：2021

卷　　号：42

期　　号：1

起止页码：51-56

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：【目的】本研究旨在对RhD阳性个体中红细胞特异性表达的RHD基因不同转录本进行分析,并对选择性剪接发生的机制进行初步探讨。【方法】利用体外有核红细胞培养体系分离并培养RhD阳性个体的有核红细胞,使用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术对RhD阳性个体RHD基因外显子6至3’非编码区扩增后进行二代测序,分析mRNA转录本,并采用生物信息学方法分析RHD基因所有外显子5’及3’剪接位点的最大熵值。【结果】RHD基因的转录本以正常全长mRNA为主,除此之外还存在其他8种异常转录本。按照表达量从多到少,分别为外显子7缺失、外显子9缺失、外显子8和9缺失、外显子7、8和9缺失、外显子7和9缺失、外显子8和9缺失合并外显子7与10间插入一段170 bp的内含子7片段、全长mRNA但插入170 bp的内含子7片段和外显子9缺失但插入一170 bp的内含子7片段,其中最后3种为新转录本。生物信息学分析提示外显子7和外显子9异常剪接可能与其5’-剪接位点(5’-splice site,5’ss)或3’ss和剪接体结合能力下降有关,而内含子7片段异常表达于转录本中可能与其两端存在类似5’ss和3’ss剪接保守序列有关。【结论】RHD基因存在十分复杂的选择性剪接模式,使RhD阳性个体的RHD基因在mRNA水平上存在多种不同的剪接转录本。

关 键 词：RhD阳性  二代测序  转录本 剪接

分 类 号：R331.1] R41[基础医学类]