文献类型：期刊文章

作　　者：杜荣松[1,2] 许茹[2,3] 黄杰庭[2,3] 王敏[2,3] 廖峭[2,3] 单振刚[2,3] 戎霞[2,3] 王淏[2] 郑优荣[2] 付涌水[1,2]

DU Rong-song;XU Ru;HUANG Jie-ting;WANG Min;LIAO Qiao;SHAN Zhen-gang;RONG Xia;WANG Hao;ZHENG You-rong;FU Yong-shui(Department of Transfusion Medicine,School of Laboratory Medicine and Biotechnology,Southern Medical University,Guangzhou,Guangdong,China 510515;Guangzhou Blood Center;The Key Medical Disciplines and Specialties Program of Guangzhou)

机构地区：[1]南方医科大学检验与生物技术学院输血医学系,广东广州510515 [2]广州血液中心 [3]广州市医学重点实验室(血液安全重点实验室)

出　　处：《中国病原生物学杂志》

基　　金：国家自然科学基金项目(No.81772208);广东省医学科学技术研究基金项目(No.B2020090);广州市医学重点学科建设项目(血液安全重点实验室)。

年　　份：2020

卷　　号：15

期　　号：11

起止页码：1241-1245

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的了解广州地区丙型肝炎病毒(HCV)主要流行基因型E1蛋白胞外域氨基酸序列突变特征。方法采集2012-2018年380例广州地区HCV感染者血液标本,使用试剂盒提取HCV RNA,进行Core/E1区序列巢式PCR扩增和测序,采用Mega 7.0构建系统进化树进行基因分型,对广州地区流行的HCV主要基因型的E1胞外域部分序列进行氨基酸翻译和构建共有序列,利用生物信息软件、统计软件分析HCV E1胞外域氨基酸位点突变的分布特征、替换模式及与宿主免疫的关系。结果广州地区HCV主要流行基因型为1b和6a,分别占38.68%和41.84%;1b和6a基因型E1蛋白胞外域(aa 192-320)发生突变的氨基酸位点分别有62个(48.1%)和60个(46.5%),差异无统计学意义(χ^2=2.04,P>0.05);突变主要发生在aa 192-260区段,1b型的高度突变位点(突变率≥20%)比较分散,6a型则集中在aa231-243区段;高度突变位点均处于免疫表位区,BLOSUM评分显示大部分突变位点氨基酸替换模式为保守性替换。结论HCV基因型1b和6a蛋白E1胞外域的高度突变位点主要位于免疫表位区,大部分突变为保守性替换而且种类多样,可能与免疫压力有关。

关 键 词：丙型肝炎病毒 基因型 突变 疫苗

分 类 号：R373.21]