期刊文章详细信息
石榴NAC转录因子家族的生物信息学分析
Bioinformatic Analysis of the NAC Transcription Factor Family in Punica granatum L.
文献类型:期刊文章
Li Shenglong;Wang Chuanming;Li Xiaojing(Key Laboratory of Crop High Quality and Efficient Cultivation and Security Control of College in Yunnan Province,College of Life Science and Technology,Honghe University,Mengzi,661100)
机构地区:[1]红河学院生命科学与技术学院,云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室,蒙自661100
基 金:云南省科技厅基础研究青年项目(2016FD091);红河学院硕博项目(XJ16B06);红河学院生物学重点建设学科项目(2018ZDXK09)共同资助。
年 份:2021
卷 号:19
期 号:1
起止页码:88-99
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:NAC (NAM-ATAF1/2-CUC2)是植物特有的转录因子大家族之一,其参与植物叶片的衰老、花的形成、种子的发育、根的发育、次生细胞壁的合成、激素的信号转导、果实的成熟及着色等生长发育过程。本研究基于石榴基因组数据库,从中鉴定了73个NAC基因;运用生物信息学方法分析NAC基因家族的蛋白理化性质、基因结构、保守结构域、进化和基因表达。结果表明,NAC基因可分为9个亚族。基于不同组织器官的转录组数据,分析了Pg NAC基因的表达模式,发现Pg NAC30有可能在石榴根系的发育中起重要作用;Pg NAC3和Pg NAC13有可能参与调控石榴种子大小,Pg NAC32有可能调控石榴果实成熟发育,Pg NAC49参与调控石榴种子木质素的生物合成。该研究结果为石榴NAC家族基因功能研究,探索NAC调控石榴果实发育及品质形成提供参考,为石榴的分子育种提供科学依据。
关 键 词:石榴(Punica granatum L.) NAC基因家族 系统进化 基因结构 表达分析
分 类 号:S665.4]
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