文献类型：期刊文章

作　　者：于志君[1] 袁琼[1] 金志刚[2] 向梓非[1] 龙萍[2] 朱明[2] 杨越旺[3] 胡霞敏[3]

YU Zhijun;YUAN Qiong;JIN Zhigang;XIANG Zifei;LONG Ping;ZHU Ming;YANG Yuewang;HU Xiamin(Institute of Pharmaceutical Innovation,Hubie Provincial Key Laboratory of Occupational Hazard Identification and Control,Wuhan University of Science and Technology,Wuhan 430065,China;China Resources&WISCO General Hospital,Wuhan 430080;Shanghai University of Medicine and Health Sciences,Shanghai 200030)

机构地区：[1]武汉科技大学医学院,新药创制研究所,职业危害识别与控制湖北省重点实验室,武汉430065 [2]华润武钢总医院,武汉430080 [3]上海健康医学院,上海200030

出　　处：《中国实验动物学报》

基　　金：国家自然科学基金(81770377);湖北省自然科学杰出青年基金(2020CFA076);湖北省卫生计生委科研项目(WJ2019H164)。

年　　份：2020

卷　　号：28

期　　号：6

起止页码：765-772

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的应用RIP-Seq测序技术检测小鼠MCAO/R模型中心肌素相关转录因子A(MRTF-A)结合RNA的表达差异,探讨MRTF-A潜在的作用机制。方法将C57BL/6小鼠随机分成假手术组及I/R组,线栓法构建MCAO模型,再灌注24 h后,提取脑组织总蛋白,利用MRTF-A抗体免疫共沉淀后,进行RNA高通量测序,获得MRTF-A结合RNA的表达谱,继而对差异RNA进行GO、KEGG分析。结果与假手术组相比,I/R组有429个RNA发生差异表达(上调203,下调226),并且在功能元件和染色体分布上均具有显著差异。GO分子功能分析显示,差异表达RNA主要富集RNA结合、Poly(A)RNA结合等注释。KEGG通路分析显示10条通路被显著富集,其中雌激素信号通路富集最显著。结论在脑I/R损伤时MRTF-A结合RNA表达谱发生差异改变,为深入探讨MRTF-A的分子机制提供理论依据。

关 键 词：心肌素相关转录因子A  RNA结合蛋白免疫共沉淀-高通量测序  脑缺血再灌注损伤 差异基因分析  

分 类 号：Q95-33]