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期刊文章详细信息

滇黄精转录组测序及类黄酮合成相关基因的分析    

Analysis of transcriptome sequencing and related genes of flavonoids biosynthesis from Polygonatum kingianum

  

文献类型:期刊文章

作  者:肖韵铮[1] 韩世明[2] 秦昭[1] 李春奇[1]

XIAO Yunzheng;HAN Shiming;QIN Zhao;LI Chunqi(College of Life Sciences, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, China;College of Biological Science and Technology, Liupanshui Normal University, Liupanshui 553000, China)

机构地区:[1]河南农业大学生命科学学院,河南郑州450002 [2]六盘水师范学院生物科学与技术学院,贵州六盘水553000

出  处:《河南农业大学学报》

基  金:贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字[2018]371);六盘水特色果树资源研究与利用重点实验室项目(52020-2017-02-03);六盘水师范学院高层次人才科研启动基金项目(LPSSYKYJJ2016)。

年  份:2020

卷  号:54

期  号:6

起止页码:931-940

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、ZGKJHX、核心刊

摘  要:为了丰富滇黄精不同器官发育的转录组数据,筛选参与类黄酮生物合成的关键基因,对滇黄精根、茎和叶进行转录组测序,并对参与类黄酮生物合成的差异基因进行筛选分析。转录组测序共获得219769条unigenes,平均长度502.31 bp,N50为627 bp。通过数据库(NR、eggNOG、Pfam、Swiss-Prot、KEGG、GO、KOG、COG)对unigenes进行功能基因注释,分别有76179、67055、45508、35287、26259、39479、43295和24524条unigenes获得注释。基于转录组测序分析,筛选出10个与滇黄精类黄酮生物合成相关的差异基因,通过qRT-PCR检测差异基因在滇黄精不同器官中的表达水平,并与类黄酮含量进行相关性分析,确认CHI和CHS是滇黄精类黄酮生物合成途径中的关键基因,其基因的表达量决定了类黄酮的合成量。

关 键 词:滇黄精 转录组 类黄酮 差异基因

分 类 号:S147.2] S517]

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