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期刊文章详细信息

高粱SbRLK2基因的克隆及表达模式分析    

Cloning and Expression Pattern Analysis of SbRLK2 Gene in Sorghum bicolor

  

文献类型:期刊文章

作  者:张瑶[1] 陈磊[1] 马乐[1] 张朝政[1] 乐超银[1]

Zhang Yao;Chen Lei;Ma Le;Zhang Chaozheng;Yue Chaoyin(Bioechnology Research Center,Collge of Biological and Pharmaceutical Sciences,China Three Gorges Unvesity,Yichang,443002)

机构地区:[1]三峡大学生物与制药学院,生物技术研究中心,宜昌443002

出  处:《分子植物育种》

基  金:武汉大学杂交水稻国家重点实验室(KF201507)资助。

年  份:2020

卷  号:18

期  号:22

起止页码:7276-7282

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:LRR-RLK家族基因编码的类受体激酶,在植物、动物的抗病过程中起着重要作用,本研究从高粱转录组测序的差异表达序列中筛选到1条具有完整开放阅读框的LRR-RLK基因序列,设计特异性引物并克隆,通过生物信息学方法分析该基因的序列特征、编码蛋白的理化特性、结构域以及进化关系等,并应用荧光定量PCR技术分析该基因在高粱不同组织中的表达活性。结果表明,克隆得到的LRR-RLK基因开放阅读框为1 233 bp,命名为"SbRLK2"。SbRLK2编码410个氨基酸,具有典型的LRR型类受体蛋白激酶结构DNA仅与小米及二穗短柄草具有较高同源性:其编码的蛋白与禾本科LRR-RLKs具有较高的同源性。SbRLK2蛋白质理论分子量为45.017 kD,理论等电点为5.85;是稳定疏水性蛋白,具有1个跨膜结构,不存在信号肽;亚细胞预测该基因主要在细胞核(30%)、微体(29%)、和线粒体(10%)中发挥生物学作用。组织特异性表达分析发现,SbRLK2在高粱的花序和叶中高表达,表达量分别是根部的41.3倍和54.3倍。SbRLK2基因在抗病高粱品种中表达量在接种丝黑穗病菌24 h后大幅度增加,72 h后表达量有所回落,而在感病品种中的表达量则一直较低,表达差异极显著,说明该基因与高粱的抗丝黑穗病相关。本研究结果为SbRLK2基因对高粱抗病的响应模式研究提供了理论参考。

关 键 词:高粱 SbRLK2基因克隆  生物信息学 丝黑穗病诱导  表达模式  

分 类 号:S514] Q943.2[植物生产类]

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