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期刊文章详细信息

温室白粉虱触角转录组分析及嗅觉相关基因的鉴定    

Analysis of the Antennal Transcriptome and Identification of Olfaction-related Genes of Trialeurodes vaporariorum

  

文献类型:期刊文章

作  者:蔡赛波[1,2] 尹朝坤[3] 张蔓[1,2] 林连兵[1,2] 张棋麟[1,2]

CAI Sai-Bo;YIN Chao-Kun;ZHANG Man;LIN Lian-Bing;ZHANG Qi-Lin(Faculty of Life Science and Technology,Kunming University of Science and Technology,Kunming 650500,China;Engineering Research Center for Replacement Technology of Feed Antibiotics of Yunnan College,Kunming 650500,China;School of Electrical and Information Engineering,Changzhou Institute of Technology,Changzhou 213032,China)

机构地区:[1]昆明理工大学生命科学与技术学院,昆明650500 [2]云南省高校饲用抗生素替代技术工程研究中心,昆明650500 [3]常州工学院电气信息工程学院,常州213032

出  处:《农业生物技术学报》

基  金:国家自然科学基金(31960286);云南省教育厅科学研究基金(2019J0050)。

年  份:2020

卷  号:28

期  号:11

起止页码:2048-2060

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、UPD、ZGKJHX、核心刊

摘  要:温室白粉虱(Trialeurodes vaporariorum)具有多食性、寄主范围广泛等特点,是一种世界性的温室害虫,防治难度极大。触角是昆虫信息交流的重要器官,其中的嗅觉相关基因是调控昆虫取食行为的重要分子基础。然而,迄今为止对温室白粉虱触角基因数据还鲜有报道,对主要嗅觉相关基因的数量和类型还知之甚少。本研究旨在建立温室白粉虱触角转录组数据库,并调查触角中嗅觉相关蛋白编码基因数量。以温室白粉虱成虫触角为材料,利用高通量测序平台Illumina HiSeq 4000对其进行转录组测序,并进行生物信息学分析。通过测序组装得到32890个unigenes,平均长度1616 bp,N50为3059 bp,其中14206个unigenes长度大于1000 bp。通过与基因功能数据库注释,其中17846个unigenes获得功能注释信息。其中,与非冗余蛋白数据库(non-redundant protein sequence database,NR)数据库比对到最多的序列,占所有注释unigenes的88.77%,与烟粉虱(Bemisia tabaci)基因注释到的序列最多,占NR注释unigenes的87.12%。GO数据库比对发现,温室白粉虱触角转录组unigenes功能可分为3大类54个亚类,其中参与代谢进程以及催化活性的unigenes比例较大。KEGG数据库注释结果显示,5964条unigenes中注释到228个代谢通路,其中包含unigenes最多的代谢通路为核糖体,为189条。进一步基于基因注释信息,鉴定到33个温室白粉虱嗅觉相关蛋白编码基因,包括气味结合蛋白(odorant-binding proteins,OBPs)编码基因21个,化学感受蛋白(chemosensory proteins,CSPs)编码基因5个,嗅觉受体(olfactory receptors,OLRs)编码基因2个,气味受体(odorant receptors,ORs)编码基因3个,离子型受体(ionotropic receptors,IRs)编码基因1个,感觉神经元膜蛋白(sensory neuron membrane proteins,SNMPs)编码基因1个。本研究获得了温室白粉虱成虫触角转录组数据,初步阐明了温室白粉虱触角转录组的特征,并挖掘了嗅觉相关蛋白编码基因,

关 键 词:温室白粉虱 触角转录组  基因注释 嗅觉相关基因  气味结合蛋白

分 类 号:S436]

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