文献类型：期刊文章

作　　者：杨正钊[1] 王梓豪[1] 胡兆荣[1] 辛明明[1] 姚颖垠[1] 彭惠茹[1] 尤明山[1] 宿振起[1] 郭伟龙[1]

YANG Zheng-Zhao;WANG Zi-Hao;HU Zhao-Rong;XIN Ming-Ming;YAO Ying-Yin;PENG Hui-Ru;YOU Ming-Shan;SU Zhen-Qi;GUO Wei-Long(College of Agronomy and Biotechnology/State Key Laboratory for Agrobiotechnology/Key Laboratory of Crop Heterosis and Utilization,Ministry of Education,China Agricultural University,Beijing 100193,China)

机构地区：[1]中国农业大学农学院/农业生物技术国家重点实验室/杂种优势研究与利用教育部重点实验室,北京100193

出　　处：《作物学报》

基　　金：国家重点研发计划项目(2018YFD0100803);国家自然科学基金项目(31701415);中央高校基本科研业务费专项资助。

年　　份：2020

卷　　号：46

期　　号：12

起止页码：1870-1883

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EBSCO、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：济麦22和良星99是我国黄淮冬麦区和北部冬麦区大面积推广的高产小麦品种,也是目前小麦杂交育种的重要亲本。虽然济麦22和良星99的来源和系谱不同,但在重要农艺、产量等性状上存在较高的相似性。为了从全基因组水平研究其遗传组成的异同,本研究采用IlluminaHiSeq2500测序平台对上述两个品种进行了全基因组测序(平均测序深度为5.8×),并系统地比较了两个品种拷贝数变异(CNV)、单核苷酸多态性(SNP)和插入/缺失(InDel)的序列差异。与中国春参考基因组序列相比,两个品种除了具有总长466 Mb的共有CNV变异区间外,济麦22和良星99的特有CNV变异区间的总长分别为91Mb和45Mb,这些特有CNV区间主要集中在2B和4B染色体上;济麦22和良星99间存在1,547,371个SNP差异位点和137,817个InDel差异位点。以差异SNP分布规律为依据,在全基因组水平鉴定出济麦22和良星99间存在14.2%的差异多态性热点区间,这些区间集中分布在1D、2B和4B染色体上。通过对5个控制小麦株高和穗长基因的序列分析,发现有2个位于多态性热点区间的基因在品种间存在移码突变。本研究为利用重测序数据在基因组水平上比较小麦品种间遗传差异提供了重要参考,同时揭示了济麦22和良星99在全基因组的遗传相似区间和差异区间,为今后小麦育种改良中更好利用济麦22与良星99提供了重要遗传信息。

关 键 词：小麦 济麦22  良星99  全基因组重测序  SNP CNV

分 类 号：S512.1]