期刊文章详细信息
文献类型:期刊文章
YANG Xiao-rong;LAI Xiao-hui;OREN Akhberdi;JIAO Zi-wei;ZHANG Xiang-feng(Schl.of Biol.&Geograph.Sci.,Yili Normal Uni.,Yining 835000)
机构地区:[1]伊犁师范大学生物与地理科学学院,新疆伊宁835000
基 金:伊犁师范大学微生物重点实验室科研项目(YLUKLM2018001)。
年 份:2020
卷 号:40
期 号:4
起止页码:24-33
语 种:中文
收录情况:CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、ZGKJHX、普通刊
摘 要:采集昭苏县野生羊肚菌(Morchella esculenta)根际水平直径10 cm、深度0~30 cm范围内的3层各10 cm土壤样品,利用Illumina miseq 2×300 bp高通量测序技术和生物信息学分析方法检测细菌类群的多样性。结果显示,细菌群落Chao和Shannon指数在0~30 cm土层中的平均值分别为152和3.68,且两种指数在10~20 cm土层均最高;细菌群落在各分类水平上的类群(最大类群丰度)分别为变形菌门(Proteobacteria,36.3%)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)等13门;黄杆菌科(Flavobacteriaceae,8.4%)、芽胞杆菌科(Bacillaceae)和葡萄球菌科(Staphylococcaceae)等43科;葡萄球菌属(Staphylococcus,7.1%)、杆状菌属(Bacillus)和Cloacibacterium等52属;不能培养的α-变形杆菌(unculturedα-proteobacterium,2.0%)、不能培养的嗜甲基菌科1种(uncultured Methylophilaceae bacterium)和路西法芽胞杆菌(Bacillus luciferensis)等44种。检测到固氮菌32属,包括15属自生固氮菌、9属共生固氮菌和8属联合固氮菌。结果表明,羊肚菌土壤根际微生物样品中细菌类群具有多样性,10~20 cm土层根际微生物多样性较高,但很多种类丰度较低;该土样含有丰富的固氮菌,这对栽培羊肚菌如何选地或覆土具有一定的指导意义。
关 键 词:宏基因组 人工驯化 根际土壤微生物 固氮菌
分 类 号:Q939.96]
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