文献类型：期刊文章

作　　者：张宁[1] 盛爱民[1] 马世堂[2]

ZHANG Ning;SHENG Aimin;MA Shitang(School of Chemical Engineering,Anhui University of Science and Technology,Huainan 232000,China;Life and Health College,Anhui Science and Technology University,Fengyang 233100,China)

机构地区：[1]安徽理工大学化学工程学院,安徽淮南232000 [2]安徽科技学院生命与健康科学学院,安徽凤阳233100

出　　处：《安徽科技学院学报》

基　　金：安徽省高校自然科学研究重大项目(KJ2020ZD011)。

年　　份：2020

卷　　号：34

期　　号：4

起止页码：37-42

语　　种：中文

收录情况：普通刊

摘　　要：目的:研究人源前列腺癌组织DLL3基因生物信息学。方法:利用NCBI、ProtParam、DNASTAR、STRING、BioGPS、GEPIA、CCLE、TIMER等8个生物信息学平台,分别对人源DLL3基因序列、蛋白质理化性质、二级结构、疏水性以及DLL3基因在前列腺癌组织的表达情况进行分析。结果:人DLL3基因编码区长1857 bp,共618个氨基酸,分子式为C2791 H4376 N846 O 825 S51,相对分子质量为64617.68,理化性质不稳定,二级结构以无规则卷曲为主,是一种亲水性蛋白质。通过BioGPS数据库分析DLL3 mRNA在正常的前列腺组织、T细胞和B细胞中DLL3表达水平较低;GEPIA显示在前列腺癌组织中DLL3的表达水平有所升高;CCLE显示在前列腺癌组织的T细胞中DLL3处于低表达,但在B细胞中表达略有升高。TIMER显示在前列腺癌免疫微环境中,DLL3的表达水平与免疫细胞B细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞、CD4+T细胞、中性粒细胞和树突状细胞呈负相关,共表达量下降,但与肿瘤纯度呈正相关(偏相关系数partial.cor=0.187),表达量增加。结论:利用生物信息学方法对人DLL3基因及其蛋白进行研究,为前列腺癌等疾病的研究和相关药物研发提供相应参考。

关 键 词：生物信息学 DLL3基因  蛋白结构 前列腺癌 表达水平  

分 类 号：Q-9[生物科学类]