期刊文章详细信息
基于环境DNA宏条形码的洱海鱼类多样性研究
INVESTIGATING THE FISH DIVERSITY IN ERHAI LAKE BASED ON ENVIRONMENTAL DNA METABARCODING
文献类型:期刊文章
SHU Lu;LIN Jia-Yan;XU Yuan;CAO Te;FENG Ji-Meng;PENG Zuo-Gang(Key Laboratory of Freshwater Fish Reproduction and Development(Ministry of Education),Southwest University School of Life Sciences,Chongqing 400715,China;Institute of Hydrobiology,Chinese Academy of Sciences,Wuhan 430072,China;Yunnan Dali Research Institute of Shanghai Jiao Tong University,Dali 671000,China)
机构地区:[1]西南大学生命科学学院,淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室,重庆400715 [2]中国科学院水生生物研究所,武汉430072 [3]上海交通大学云南(大理)研究院,大理671000
基 金:国家重点研发计划项目(2018YFD0900805);国家自然科学基金(31872204)资助。
年 份:2020
卷 号:44
期 号:5
起止页码:1080-1086
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:研究使用环境DNA宏条形码(eDNA metabarcoding)检测洱海鱼类多样性,探索适用于洱海鱼类多样性监测和保护的新方法。通过水样采集、过滤、eDNA提取、遗传标记扩增、测序与生物信息分析的环境DNA宏条形码标准化分析流程,从洱海16个采样点中获得可检测的9个采样点数据,共检测出17种鱼类,其中土著种5种、外来种12种;鲫(Carassius auratus)、鳙(Hypophthalmichthys nobilis)、麦穗鱼(Pseudorasbora parva)、泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)和食蚊鱼(Gambusia affinis)为优势种。研究结果表明虽然环境DNA宏条形码无法完全替代传统的鱼类监测方法,但作为一种新兴的生物多样性监测手段,其可用于快速检测洱海鱼类多样性及其空间分布。
关 键 词:环境DNA宏条形码 无创采样 物种检测 鱼类多样性
分 类 号:S932.4]
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