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期刊文章详细信息

脂肪积聚肝恶性转化模型制备及其生物信息学分析    

Establishment of malignant transformation model in lipid accumulating liver and its bioinformatics analysis

  

文献类型:期刊文章

作  者:王理[1,2,3] 潘文洁[1] 刘莹[4] 顾娟娟[5,6] 叶文欣[4] 杨婕[7] 姚敏[4]

WANG Li;PAN Wenjie;LIU Ying;GU Juanjuan;YE Wenxin;YANG Jie;YAO Min(Department of Medical Informatics,Medical School,Nantong University,Nantong 226001;Research Center for Intelligence Information Technology,Nantong University,Nantong 226001;Nantong Research Institute for Advanced Communication Technologies,Nantong University,Nantong 226001;Department of Medical Immunology,Medical School,Nantong University;Research Center of Clinical Medicine,the Affiliated Hospital of Nantong University;Department of Oncology,Haimen People's Hospital,Jiangsu Province;Life Science School,Nantong University)

机构地区:[1]南通大学医学院信息学系,南通226001 [2]南通大学智能信息技术研究中心,南通226001 [3]南通大学南通先进通信技术研究院,南通226001 [4]南通大学医学院免疫学系 [5]南通大学附属医院临床医学研究中心 [6]江苏省海门市人民医院肿瘤科 [7]南通大学生命科学院

出  处:《南通大学学报(医学版)》

基  金:国家重点研发计划资助项目(2018YFC0116902),国家自然科学基金资助项目(31872738,81673241,81873915)。

年  份:2020

卷  号:40

期  号:4

起止页码:299-304

语  种:中文

收录情况:JST、普通刊

摘  要:目的:制备非酒精性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)和诱导肝细胞恶性转化模型,观察基因表达谱动态变化。方法:雄性Sprague-Dawley(SD)大鼠分别以高脂饲料喂饲制备非酒精性脂肪积聚,以含0.05%2-乙基氨基芴(2-fluorenylacetamide,2-FAA)高脂饲料喂饲诱发鼠肝细胞恶性转化,根据肝病理学苏木精-伊红(Hematoxylin&Eosin,HE)染色检查结果分为对照(normal control,NC)、NAFLD、肝细胞变性(hepatocyte degeneration,H-deg)、癌前(precanceraion,Pre-c)和癌变(liver cancer,LC)组,脂质以油红O染色行定量分析,从肝组织抽提RNA并合成cRNA、标记、杂交和扫描,利用基因芯片分析各组差异基因表达谱动态变化,对差异表达基因行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。结果:SD鼠摄入脂肪后,肝脂肪积聚与NC组比较,NAFLD组升高9倍(t=14.78,P<0.001)、H-deg组2.4倍(t=5.96,P<0.001)、Pre-c组2.3倍(t=8.37,P<0.001)和LC组8倍(t=11.97,P<0.001)。与NC组比较全基因表达谱变化,差异表达基因NAFLD组163个,H-deg组934个,Pre-c组1452个,LC组1738个。生物学过程主要集中在细胞对刺激反应的代谢调节。肝细胞恶化转化中信号通路主要有固醇合成、P53、细胞周期信号通路,其中固醇合成通路Cyp51,Tm7sf2显著下调,Ccnb1和周期蛋白依赖性激酶1(cyclin-dependent kinases 1,CDK1)与P53通路和细胞周期相关。癌变相关标志甲胎蛋白(alpha-fetoprotein,AFP)、磷脂酰肌醇蛋白多糖-3(glypican-3,GPC-3)、CD44和Wnt3a等表达,在Pre-c组和LC组中明显上调。结论:脂肪积聚肝细胞恶性转化过程中,众多基因和信号通路参与癌变发生过程。

关 键 词:非酒精性脂肪肝 基因表达谱 肝细胞恶性转化  生物信息学 大鼠  

分 类 号:R259.73[中西医结合类]

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引证文献:

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同被引文献:

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