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期刊文章详细信息

基于致倦库蚊转录组的溴氰菊酯抗性相关基因分析    

Analysis of deltamethrin resistance-related genes based on the transcriptome of Culex pipiens quinquefasciatus

  

文献类型:期刊文章

作  者:沈瑞鑫[1] 王意婷[2] 李春晓[2] 吴家红[1] 赵彤言[2] 陈艳[1]

SHEN Rui-xin;WANG Yi-ting;LI Chun-xiao;WU Jia-hong;ZHAO Tong-yan;CHEN Yan(Department of Parasitology,Besic Medical College,Guizhou Medical University,Guiyang 550000,China;Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology,State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity,Beijing Key Laboratory of Vector Borne and Natural Focus Infectious Disease,Beijing 100071,China)

机构地区:[1]贵州医科大学基础医学院寄生虫学教研室,贵阳550000 [2]军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所,病原微生物生物安全国家重点实验室,媒介生物危害和自然疫源性疾病北京市重点实验室,北京100071

出  处:《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》

基  金:国家科技重大专项(No.2017ZX10303404)。

年  份:2020

卷  号:38

期  号:4

起止页码:453-463

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的通过对致倦库蚊溴氰菊酯敏感株和抗性株进行转录组分析,筛选可能与抗性相关的差异表达基因。方法对致倦库蚊实验室敏感株(SS株)、海南株(HN株)和溴氰菊酯药筛抗性株(RR株) 3个不同抗性水平的株系进行生物测定,分别构建3个株系的cDNA文库,提取RNA,进行转录组测序。基于FPKM值进行差异性分析,对差异基因进行GO和KEGG功能注释与富集分析。筛选出致倦库蚊不同株系中表达量有显著性差异的基因,并采用实时定量PCR验证。结果生物测定结果显示,与致倦库蚊SS株相比,HN株和RR株的抗性倍数分别达到了4 828倍和197 241倍,为高等抗性水平。RNA-seq测序结果显示,致倦库蚊SS株、HN株和RR株转录组共注释基因转录本197 079个。GO富集分析结果显示,在结合、催化活性、细胞过程、代谢过程、单一生物过程、细胞、细胞连接、细胞器中基因富集数量较多。KEGG富集分析结果显示,在富集度最高的前20个条目中,RR株主要富集于剪接体、核糖体等通路,HN株则主要富集于剪切体、RNA转运、hedgehog信号通路、细胞周期、核苷酸切除修复、DNA复制等方向。基于FPKM值的差异性分析结果显示,致倦库蚊RR株和HN株较SS株均上调的有5 357个,均下调的有10 978个。与溴氰菊酯抗性相关基因的靶向性筛选结果显示,与SS株相比,RR株和HN株注释的细胞色素P450基因、谷胱甘肽转移酶基因、气味结合蛋白基因、气味受体基因、视觉基因、核糖体蛋白基因和碳酸酐酶基因转录本中,均上调的分别为100、17、13、4、16、191和1个,均下调的分别为253、48、43、4、15、504和9个。从上调基因中挑选的12个基因(2个细胞色素P450基因、1个谷胱甘肽转移酶基因、1个视觉基因、1个核糖体蛋白基因、1个碳酸酐酶基因、1个核酸内切酶基因、2个气味结合蛋白基因、3个气味受体基因)进行实时定量PCR验证结果显示,在RR株

关 键 词:致倦库蚊 溴氰菊酯 抗性基因 转录组测序 实时定量PCR

分 类 号:R384.11]

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