文献类型：期刊文章

作　　者：韦燕红[1] 刘桢[1] 李珂[1] 孟媛[1] 汪蕙[1] 毛江萍[1] 马豆豆[1] 李少欢[1] 马娟娟[1] 卢显[1] 张东[1]

WEI Yanhong;LIU Zhen;LI Ke;MENG Yuan;WANG Hui;MAO Jiangping;MA Doudou;LI Shaohuan;MA Juanjuan;LU Xian;ZHANG Dong(College of Horticulture,Northwest A&F University,National Apple Improvement Center Yangling Sub-center,Yangling,Shaanxi 712100,China)

机构地区：[1]西北农林科技大学园艺学院国家苹果改良中心杨凌分中心,陕西杨凌712100

出　　处：《园艺学报》

基　　金：国家重点研发计划重点项目(2019YFD1001803);陕西省重点研发计划项目(2017ZDXM-NY-019,2019TSLNY02-04);国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-27);“仲英青年学者”项目。

年　　份：2020

卷　　号：47

期　　号：7

起止页码：1237-1252

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：分析了苹果miR396家族进化特性及其在苹果不定根发育过程中的表达模式。结果表明:苹果miR396家族有4条成熟体和7条前体序列(pre-miRNA)。Mfold预测显示Pre-miR396家族7个成员序列均可形成典型稳定的茎环二级结构,最小折叠自由能介于–62.9 kal·mol^-1(pre-miR396b)~–51.9kal·mol^-1(pre-miR396g)之间。系统发育进化树分析显示,pre-miR396家族亲缘关系可分为3个亚组(G1、G2、G3),每个亚组内基因数量不同,分别含有11、9、19个。靶基因预测显示,苹果miR396靶基因包括MdGRF1、MdGRF2和MdGRF5等,降解组测序进一步验证了mi R396对其候选靶基因MdGRF1、MdGRF2和MdGRF5的剪切关系。苹果miR396家族成员在侧根和果实中的表达量显著高于其他组织,其候选靶基因表达量则在花芽和腋芽中显著高于其他组织;不定根发育过程中,miR396家族不同成员表达模式存在显著差异,整体上呈上调表达趋势,其候选靶基因呈下调表达趋势;外源IBA处理显著诱导miR396家族成员的表达,尤其是在不定根诱导期和根系生长期更为显著。

关 键 词：苹果 miR396  不定根发育 生物信息学分析 基因表达  

分 类 号：S661.1]