期刊文章详细信息
喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop区遗传多样性及系统发育分析
Analyses of Genetic Diversity and Phylogeny of mtDNA D-loop from Yak in Karakoram-Pamir Area
文献类型:期刊文章
LI Jing;GUO Lijun;WANG Li;HU Ping;XIAO Yi;HAN Jianlin;WANG Yutao(College of Life and Geographic Sciences,Kashi University, Kashi 844000, China;Key Laboratory of Biological Resources and Ecology of Pamirs Plateau in Xinjiang Uygur Autonomous Region,Kashi 844000,China;Kashi No. 2 Middle School,Xinjiang, Kashi 844000,China)
机构地区:[1]喀什大学生命与地理科学学院,喀什844000 [2]新疆帕米尔高原生物资源与生态重点实验室,喀什844000 [3]新疆喀什第二中学,喀什844000
基 金:中国科学院“西部之光”项目(2018-XBQNXZ-A1-002);喀什大学创新团队建设项目((17)2602);喀什大学校内课题((17)2606)。
年 份:2020
卷 号:47
期 号:8
起止页码:2481-2492
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为明确喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛遗传多样性水平、遗传分化和系统进化地位,本研究选择mtDNA D-loop区序列作为分子标记,采用PCR直接测序和生物信息学方法分析喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop区序列特征和遗传多样性,利用GenBank中牦牛序列,采用最大似然法构建系统发育树和中介网络关系。结果显示,喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop序列富含A、T碱基,AT含量为61.2%,存在63个多态位点,占核苷酸总数的7.04%,平均单倍型多样性(Hd)为0.806,平均核苷酸多样性(π)为0.01528,平均核苷酸差异数(K)为13.509,表明喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛遗传多样性丰富;系统发育分析显示,中国境内牦牛形成两大分支,细分为6个小进化支,存在两个母系起源,表明喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛拥有两个不同的母系起源;中介网络关系分析显示,喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛与其他品种牦牛单倍型共享较少,在分支C中喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛群体所占比例较大,且与野牦牛共享。喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛群体具有较独特的遗传背景,推测可能是从早期野牦牛驯化而来。建议加大该区域牦牛品种的认定和品种标准的制定,加强对该区域牦牛遗传资源的保护;根据群体现状,引入野血牦牛进行提纯复壮,防止品种退化和遗传多样性降低;减少外来牦牛品种的引进而无序杂交,以确保优质牦牛品种资源的本品种特性。
关 键 词:喀喇昆仑-帕米尔地区 牦牛 mtDNA D-loop 遗传多样性 系统发育
分 类 号:S823.8]
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