文献类型：期刊文章

作　　者：李利利[1] 徐亚陇[2] 刘蒙蒙[3] 段招军[1]

Li Lili;Xu Yalong;Liu Mengmeng;Duan Zhaojun(NHC Key Laboratory of Medical Virology and Viral Diseases,National Institute for Viral Disease Control and Prevention,Chinese Center for Disease Control and Prevention,Beijing 100052,China;School of Public Health,Shaanxi University of Chinese Medicine,Xi'an 712046,China;Department of Medical Microbiology,Medical College of Qingdao University,Qingdao 266021,China)

机构地区：[1]国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京102206 [2]陕西中医药大学公共卫生学院,西安712046 [3]青岛大学医学部基础医学院病原生物学系,266021

出　　处：《国际病毒学杂志》

基　　金：国家重大科技专项(2018ZX10305-409-004-002)。

年　　份：2020

卷　　号：27

期　　号：3

起止页码：205-209

语　　种：中文

收录情况：JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的研究一株新型鼠类星状病毒的基因组特点和进化关系。方法采集221只山东省鼠类肠道内容物,采用高通量测序方法进行病毒组研究。结果发现一株新型星状病毒,并获得该病毒接近全长基因组,命名为RoAstV/CHN/S3。RoAstV/CHN/S3具有典型的星状病毒基因组结构,相似性分析表明与啮齿类动物星状病毒和猪星状病毒4型关系最为相近。ORF2的氨基酸遗传距离结果显示,RoAstV/CHN/S3与啮齿类动物和猪星状病毒4型的遗传距离为0.557~0.655,哺乳星状病毒属内种之间的遗传距离为0.338~0.783,推断其可能为新种。根据ORF1a、ORF1b和ORF2的系统发育树结果,RoAstV/CHN/S3与啮齿类动物星状病毒、猪星状病毒4型聚为一簇,表明这些啮齿类动物星状病毒和猪星状病毒4型具有共同祖先,也提示潜在的祖先跨种传播。对221只鼠类的肠道内容物筛查结果显示,4只鼠类为阳性,阳性率为1.8%,其中3只为褐家鼠,1只为黑线姬鼠,均来自山东省济宁市。结论新型星状病毒RoAstV/CHN/S3的发现丰富了星状病毒的多样性,为新发突发传染病的防控提供了重要的数据信息。

关 键 词：鼠类 星状病毒 基因组特点  进化

分 类 号：R373]