文献类型：期刊文章

作　　者：李林[1] 左青青[1] 谢欣[1] 刘朝波[1] 陈立[2] 张俊[2] 钱刚[1]

Li Lin;Zuo Qingqing;Xie Xin;Liu Chaobo;Chen Li;Zhang Jun;Qian Gang(Department of Cell Biology,Zunyi Medical University,ZunyiGuizhou 563009,China;The First Clinical Institute of Zunyi Medical University,Zunyi Guizhou 563099,China)

机构地区：[1]遵义医科大学基础医学院细胞生物学教研室,贵州遵义563099 [2]遵义医科大学第一临床学院,贵州遵义563099

出　　处：《遵义医科大学学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(NO:31560079,NO:31560102,NO:31960074);贵州省科技厅人才成长项目(KY[2017]194)。

年　　份：2020

卷　　号：43

期　　号：3

起止页码：305-309

语　　种：中文

收录情况：JST、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的对具有良好抗菌性的千里光进行pal基因克隆,进行序列结构与系统进化分析,揭示该酶生物学功能与进化地位。方法以千里光转录组数据库中分离得到pal基因核酸序列设计引物,PCR扩增全长验证,运用SignalP、MEGA等系列生物信息学软件进行核酸序列信息、氨基酸结构特征与系统进化分析。结果克隆获得长度为2159 bp的核酸序列,ORF分析表明该基因编码708个氨基酸,无信号肽,是非跨膜蛋白。与近缘物种pal基因blast分析表明其氨基酸序列与黑心菊、雪莲等相似度达92.22%,具有相同的活性位点和保守结构域。系统进化树分析表明,千里光与菊科植物青蒿、雪莲归于一个亚支,表明3种植物pal在进化上具有较近的亲缘关系。结论千里光pal基因序列结构与其他14种PAL酶家族成员相似度高,在进化上与菊科植物较近。

关 键 词：千里光 生物信息学分析 苯丙氨酸裂解酶(PAL)  进化分析

分 类 号：Q811.4[生物工程类]