文献类型：期刊文章

作　　者：卫佳宁[1] 高继萍[1] 续国强[1] 王晓堂[1] 宋国华[2]

Wei Jianing;Gao Jiping;Xu Guoqiang;Wang Xiaotang;Song Guohua(Laboratory Animal Center Shanxi Medical University,Shanxi Key Laboratory of Experimental Animal Science and Human Disease Animal Model,Taiyuan030001,China)

机构地区：[1]山西医科大学实验动物中心,太原030001 [2]山西医科大学附属精神卫生医院

出　　处：《中国药物与临床》

年　　份：2020

卷　　号：20

期　　号：14

起止页码：2321-2324

语　　种：中文

收录情况：CAS、JST、普通刊

摘　　要：目的探讨中国地鼠口腔鳞状细胞癌(鳞癌)全转录组测序中非编码RNA差异表达的关系。方法应用高通量测序技术和生物信息学软件分析中国地鼠口腔鳞癌相关非编码RNA数据,筛选在口腔鳞癌发生发展中差异表达的环状RNA(circRNA)和微RNA(mi RNA)。通过mi Randa靶向预测差异circRNA-miRNAmRNA之间的互作关系,Cytoscape软件建立circRNA-miRNA互作网络图,并结合实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法验证靶向互作关系在口腔鳞癌中的表达情况。结果从高通量测序结果中筛选了14个共表达circRNAs和75个共表达mi RNAs,成功构建了口腔鳞癌相关circRNA-miRNA网络,结合软件预测到了cgr_circ_Man2a1/cgr_miR-1260/Notch2和cgr_circ_Pdcd4/cgr-miR-15b-5p/Akt3 2条通路,并在基因水平验证了通路中基因的表达关系。结论本研究为circRNA的竞争性内源机制在口腔鳞癌的发生发展中的研究提供了新的见解,为进一步研究奠定基础。

关 键 词：口腔肿瘤 鳞状细胞癌 高通量测序 非编码RNA

分 类 号：R739.8]