文献类型：期刊文章

作　　者：赵思越[1] 李才武[2] 杨盛智[1] 李果[2] 何永果[2] 吴代福[2] 黄炎[2] 张和民[2] 邹立扣[1]

ZHAO Siyue;LI Caiwu;YANG Shengzhi;LI Guo;HE Yongguo;WU Daifu;HUANG Yan;ZHANG Heming;ZOU Likou(Faculty of Applied Microbiology,College of Resources,Sichuan Agricultural University,Chengdu 611130,China;Key Laboratory of State Forestry and Grassland Administration on Conservation Biology of Rare Animals in the Giant Panda National Park,China Conservation and Research Center for the Giant Panda,Dujiangyan 611830,China)

机构地区：[1]四川农业大学资源学院应用微生物学系,成都611130 [2]中国大熊猫保护研究中心大熊猫国家公园珍稀动物保护生物学国家林业和草原局重点实验室,都江堰611830

出　　处：《应用与环境生物学报》

基　　金：大熊猫国家公园珍稀动物保护生物学国家林业和草原局重点实验室开放基金项目(中国大熊猫保护研究中心,KLSFGAGP2020.003);国家自然科学基金项目(31400066)资助。

年　　份：2020

卷　　号：26

期　　号：3

起止页码：489-498

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：噬菌体在维持宿主肠道微环境中起着重要作用.运用宏基因组学方法全面探究大熊猫肠道噬菌体的多样性.共注释到548种噬菌体,主要来自11个科38个属548个种.大多数噬菌体主要来自长尾病毒科Siphoviridae、肌尾噬菌体科Myoviridae和短尾噬菌体科Podoviridae,所占比例分别为41.7%、27.6%和19.5%.其中未分类到科的噬菌体占10.5%.38个属主要为λ样病毒属(10.3%)、T4样病毒属(8.0%)、P1样病毒属(7.1%)、Phieco32样病毒属(5.3%)、T5样噬菌体属(3.4%)等.548个噬菌体中有22种丰度超过了1%,主要为肠细菌噬菌体P1(7.0%)、链球菌噬菌体LYGO9(6.1%)、肠细菌噬菌体λ(5.3%)、肠细菌噬菌体Phieco32(5.2%)、链球菌噬菌体phi30c(3.8%)等.此外,不同大熊猫繁育基地之间噬菌体群落结构存在显著差异(科水平:R=0.168,P<0.01;属水平:R=0.128,P<0.01;种水平:R=0.291,P<0.01),在α多样性指数方面SSP基地的Chao1指数与其他两个基地之间存在着显著差异.本研究发现大熊猫肠道噬菌体种群丰富多样,且因生境不同而显著变化;结果有助于挖掘大熊猫肠道噬菌体在疾病防控及治疗的潜力,为保障大熊猫的肠道健康提供新的思路.

关 键 词：大熊猫 宏基因组学 噬菌体 肠道微生物 生境

分 类 号：Q958]