文献类型：期刊文章

作　　者：黄小芳[1,2] 毕楚韵[1,2] 石媛媛[2] 胡韵卓[3] 周丽香[4] 梁才晓[4] 黄碧芳[4] 许明[1,2] 林世强[1,4] 陈选阳[1,2,5]

HUANG Xiao-Fang;BI Chu-Yun;SHI Yuan-Yuan;HU Yun-Zhuo;ZHOU Li-Xiang;LIANG Cai-Xiao;HUANG Bi-Fang;XU Ming;LIN Shi-Qiang;CHEN Xuan-Yang(Key Laboratory of Crop Biotechnology,Fujian Agriculture and Forestry University,Fujian Province Universities,Fuzhou 350002,Fujian,China;College of Agriculture,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,Fujian,China;College of Plant Protection,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,Fujian,China;College of Life Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,Fujian,China;Key Laboratory of Genetics,Breeding and Multiple Application of Crops,Ministry of Education,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,Fujian,China)

机构地区：[1]福建农林大学作物生物技术福建省高校重点实验室,福建福州350002 [2]福建农林大学农学院,福建福州350002 [3]福建农林大学植物保护学院,福建福州350002 [4]福建农林大学生命科学学院,福建福州350002 [5]福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室,福建福州350002

出　　处：《作物学报》

基　　金：福建省科技重大专项子专题(2017NZ0002-2)资助。

年　　份：2020

卷　　号：46

期　　号：8

起止页码：1195-1207

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EBSCO、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：NBS-LRR类基因家族是植物抗病R基因(Resistance gene)数量最多的一类,具有NBS(Nucleotide-binding site)和LRR(Leucine-leucine-repeat)结构域。甘薯(Ipomoea batatas)栽培种基因组已完成测序,但尚未注释,本研究对甘薯基因组序列进行外显子预测,得到甘薯染色体组全基因组蛋白序列,在此基础上进一步对NBS-LRR家族基因鉴定和分析表明,甘薯基因组中含有379个NBS-LRR家族基因,占全基因组基因总数的0.212%,其中N型亚家族120个,NL型103个,CNL型133个,TNL型22个,PN型1个。所有染色体上均有NBS-LRR家族基因分布,但数量明显不同,其中有60.9%的NBS-LRR基因序列呈簇状分布。NBS-LRR基因序列有15个保守结构域,在N端较为保守。研究结果为甘薯进一步开展NBS-LRR家族基因的功能研究和抗性育种提供了参考。

关 键 词：甘薯 NBS-LRR R基因  基因家族 生物信息学

分 类 号：S435.31]