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期刊文章详细信息

基于SNP标记的糯玉米种质资源遗传多样性分析    

Genetic Diversity of Waxy Maize Germplasm Revealed by SNP-Chips

  

文献类型:期刊文章

作  者:卢媛[1,2] 韩晴[1,2] 艾为大[3] 施标[1,2] 王义发[1] 潘春丹[4] 沈雪芳[1,2]

LU Yuan;HAN Qing;AI Wei-da;SHI Biao;WANG Yi-fa;PAN Chun-dan;SHEN Xue-fang(Crop Breeding and Cultivation Research Institute,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Shanghai 201403;CIMMYT-China Specialty Maize Research Center,Shanghai 201403;College of Agriculture,Anshun University,Anshun 561000;Agricultural Generalize Center,Shanghai 201201,China)

机构地区:[1]上海市农业科学院作物育种栽培研究所,上海201403 [2]CIMMYT—中国特用玉米研究中心,上海201403 [3]安顺学院农学院,贵州安顺561000 [4]上海市浦东新区农业技术推广中心,上海201201

出  处:《玉米科学》

基  金:上海市种业发展项目[沪农科种字(2016)第1-3号];上海市科学技术委员会科研计划项目(153919N1300,17391900100,17391902702);上海市农业科学院卓越团队项目(农科创2017B-08);上海市市级农口系统青年人才成长计划[沪农青字(2015)第1-4号];上海市市级农口系统青年人才成长计划[沪农青字(2018)第1-6号];2019上海市农业科学院青年科技人员“助跑”计划。

年  份:2020

卷  号:28

期  号:3

起止页码:44-51

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:为了提高糯玉米种质资源的利用效率,挖掘优异糯玉米种质资源、改良糯玉米品种,利用(Single nucle⁃otide polymorphism,SNP)芯片技术对44份不同来源的糯玉米自交系和5份分别代表中国玉米5大类群的普通玉米自交系进行全基因组扫描。结果表明,34257个SNP标记在49份玉米自交系中的多态性信息含量(polymorphism infor⁃mation content,PIC)为0.02~0.56,平均含量为0.32;最小等位基因频率(minor allele frequency,MAF)≥0.03。49份玉米自交系间的状态一致性(identity-by-state,IBS)变幅为0.59~0.99,平均为0.68。基于IBS利用Neighbor-joining(NJ)聚类分析方法,将49份自交系划分为5个类群,分别包含19份、9份、4份、9份和3份材料,其中系谱来源不清晰的糯玉米自交系被划分至不同类群,明确了它们的亲缘关系。

关 键 词:糯玉米 SNP标记 遗传多样性  

分 类 号:S513.024]

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