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期刊文章详细信息

重症肌无力的miRNA生物信息学分析及靶点预测    

Bioinformatics analysis and target prediction of myasthenia gravis miRNAs

  

文献类型:期刊文章

作  者:钟斯然[1] 张帆[1] 李宝铜[1] 杨斯漫[1] 韦宇婷[1] 许立拔[1] 丘芬[1]

Zhong Siran;Zhang Fan;Li Baotong;Yang Simon;Wei Yuting;Xu Liba;Qiu Fen(Key Laboratory of Pharmacology of Traditional Chinese Medicine,Pharmaceutical College,Guangxi University of Chinese Medicine)

机构地区:[1]广西中医药大学药学院中药药理重点实验室,南宁530299

出  处:《重庆医科大学学报》

基  金:广西高校中青年教师基础能力提升资助项目(编号:KY2016YB227);广西自治区大学生创新创业训练计划资助项目(编号:201810600034)。

年  份:2020

卷  号:45

期  号:6

起止页码:828-832

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的:基于重症肌无力(myasthenia gravis,MG)miRNA表达的差异,分析下游基因、信号通路和蛋白的改变。方法:从GEO下载GSE111870表达谱数据,利用Limma分析差异表达;使用TargetScan和STRING对差异miRNA-mRNA-蛋白质相互作用进行预测,构建相互作用网络,并进行GO和KEGG分析,对差异表达进行功能富集分析。受到多个差异miRNA共同调控。结果:筛选出23个差异表达miRNA,10个上调,13个下调;miRNA-mRNA预测发现7个基因(MAVS、TFAM、LPP、FBXL18、SCLT1G、RIN2B、CACNG8、GRIN2B;GO和KEGG分析发现差异表达miRNA-mRNA与神经、骨骼肌生理显著相关(P<0.001),与TGF-β信号通路显著相关(P<0.001)。通过构建蛋白质相互作用网络,发现FBXL18、GRIN2B、PRKACB、KLHL42处于蛋白相互作用的枢纽位置。结论:TFAM、MAVS、GRIN2B等基因可能与MG疾病的发生发展有关,其在MG中的作用有待进一步验证。

关 键 词:重症肌无力 MIRNA 生物信息学

分 类 号:R541.1]

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同被引文献:

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