文献类型：期刊文章

作　　者：武立伟[1,3] 崔英贤[1,3] 聂丽萍[1,3] 徐志超[1,3] 王瑀[1] 宋经元[1,3] 焦连魁[2] 姚辉[1,3]

WU Li-wei;CUI Ying-xian;NIE Li-ping;XU Zhi-chao;WANG Yu;SONG Jing-yuan;JIAO Lian-kui;YAO Hui(Key Laboratory of Bioactive Substances and Resources Utilization of Chinese Herbal Medicine,Ministry of Education,Institute of Medicinal Plant Development,Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College,Beijing 100193,China;China National Traditional Chinese Medicine Co.,Ltd.,Beijing 102600,China;Engineering Research Center of Chinese Medicine Resources,Ministry of Education,Beijing 100193,China)

机构地区：[1]中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所,中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室,北京100193 [2]中国中药有限公司,北京102600 [3]中药资源教育部工程研究中心,北京100193

出　　处：《药学学报》

基　　金：重大新药创制国家科技重大专项资助项目(2018ZX09711001-008-007);中国医学科学院医学与健康科技创新工程经费资助(2016-I2M-3-016).

年　　份：2020

卷　　号：55

期　　号：5

起止页码：1056-1066

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：细茎石斛是药用石斛的重要来源,也是正品枫斗的主要来源之一。本研究利用Illumina高通量测序技术对细茎石斛叶绿体全基因组进行测序,完成了其物理图谱绘制和基因组结构特征解析,并与近缘物种进行了比较和系统发育分析。细茎石斛叶绿体基因组全长为150 754 bp,两个反向互补重复区(IRs)长25 906 bp,大单拷贝区(LSC)和小单拷贝区(SSC)长度分别为84 818 bp和14 124 bp。共注释到123个基因,包括77个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个rRNA基因,其中17个基因含有内含子。生物信息学分析获得53个SSR位点,大多数位点具有A-T碱基偏好性。采用33条石斛属植物的叶绿体基因组序列构建系统发育树,结果显示细茎石斛复合种中的物种聚在同一个大支,说明其亲缘关系较近。本研究为细茎石斛的鉴定、细茎石斛复合种系统发育关系及其本草基因组学研究提供理论基础。

关 键 词：细茎石斛  叶绿体基因组 细茎石斛复合种  系统发育 本草基因组学  

分 类 号：R931]