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期刊文章详细信息

刚地弓形虫动力蛋白轻链8a的生物信息学分析    

Bioinformatic analysis of dynein light chain 8a of Toxoplasma gondii

  

文献类型:期刊文章

作  者:白杨[1,2] 郭旭霞[1,2] 纪爱芳[1,2] 郭步平[1,2] 弓艳娥[1,2] 杜颖超[1] 杨齐[1] 安静[1]

BAI Yang;GUO Xu-xia;JI Ai-fang;GUO Bu-ping;GONG Yan-e;DU Ying-chao;YANG Qi;AN Jing(Department of Medical Laboratory Science,Changzhi Medical College,Changzhi,Shanxi,China 04600;Department of Clinical Laboratory Science,Heping Hospital Affiliated with Changzhi Medical College)

机构地区:[1]长治医学院医学检验系,山西长治046000 [2]长治医学院附属和平医院检验科,山西长治046000

出  处:《中国病原生物学杂志》

基  金:山西省卫生和计划生育委员会科研课题(No.2017159);山西省高等学校大学生创新创业训练项目(No.2017299);长治医学院科研启动基金项目(No.QDZ201627)。

年  份:2020

卷  号:15

期  号:4

起止页码:438-443

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的通过生物信息学在线程序及软件分析弓形虫动力蛋白轻链8a(TgDLC8a),预测其结构、免疫原性及抗原性。方法利用生物信息学在线软件ProtParam、SOSUI、ProtScale、TMHMM Server v.2.0、SignalP-5.0、TargetP1.1、Coils、SOPMA、NetPhos 3.1Server、SWISS-MODEL、SYFPEITHI及DNAMAN软件、DNAStar软件等分析预测TgDLC8a蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜结构域、信号肽、亚细胞定位、可溶性、柔韧性、表面可及性、二级结构、蛋白翻译后修饰位点、三级结构及B细胞和T细胞抗原表位。结果TgDLC8a蛋白含有138个氨基酸,分子式为C723H1128N192O195S11,相对分子质量为15.92874×10^3,理论等电点为8.69,半衰期为30h,不稳定系数为37.09,脂溶性指数为88.33,总平均亲水性系数为0.025,属于疏水性蛋白;该蛋白有跨膜结构域,无信号肽切割位点,亚细胞定位预测可能是分泌蛋白;二级结构中α螺旋和β折叠分别占41.30%和23.91%,β转角和无规则卷曲分别占5.80%和28.99%;三级结构以二聚体的形式存在。该蛋白含有7个磷酸化修饰位点,其中4个丝氨酸磷酸化位点,2个苏氨酸磷酸化位点,1个酪氨酸磷酸化位点;含有7个B细胞抗原表位,7个CTL细胞抗原表位,11个Th细胞抗原表位。结论生物信息学预测TgDLC8a蛋白具有多个潜在的B细胞抗原表位及CTL细胞和Th细胞抗原表位,具有免疫原性和抗原性,可作为为抗弓形虫病疫苗候选蛋白。

关 键 词:刚地弓形虫 TgDLC8a  生物信息学 免疫原性

分 类 号:R382.5]

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