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基于随机序列的固有无序蛋白预测算法比较分析
Comparative analysis of intrinsic disordered proteins predictors based on random sequences
文献类型:期刊文章
DONG Qing-qing;ZHAO Ya-wei;YUAN Zeng;YU Jia-feng;WANG Fang-hua;TANG Hu-cheng(Shandong Key Lab of Biophysics,Institute of Biophysics,Dezhou University,Dezhou 253023;The Fourth People′s Hospital,Zibo 255067,China)
机构地区:[1]德州学院生物物理研究院山东省生物物理重点实验室,德州253023 [2]淄博市第四人民医院,淄博255067
基 金:山东省自然科学基金重点项目(ZR2016JL027);国家自然科学基金项目(61271378);国家级大学生创新创业训练计划项目(201710448129)。
年 份:2020
卷 号:37
期 号:3
起止页码:46-49
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、PROQUEST、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:固有无序蛋白质(IDPs)是一种普遍存在且缺乏稳定空间结构的重要功能蛋白,为传统的蛋白质序列-结构-功能研究模式提出了挑战,成为当前蛋白质科学研究的热点领域。由于其特殊的柔性结构特征,IDPs的实验研究难度大,通过计算方法来预测IDPs成为IDPs研究的重要手段。然而由于被实验证实的IDPs还很少,对IDPs预测算法的有效评价还缺少可靠的数据集,因而通过人工设计随机蛋白序列并提出分析数理模型,从无序区残基分布、组成等多角度对两种代表性IDPs预测算法的预测结果进行了深入对比研究。结果表明各随机序列中不同IDPs预测算法得到的预测结果具有不同程度的差别,预测得到的无序区与天然蛋白中无序区序列特征一致,因此对IDPs的研究应充分考虑不同预测算法差异特征,提高研究结果的可靠性。
关 键 词:蛋白质 固有无序蛋白 序列分析
分 类 号:Q811.4[生物工程类] Q51
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