期刊文章详细信息
海南油茶SRAP-PCR体系优化及有效引物筛选
Optimization of SRAP-PCR System and Screening of Effective Primers for Tea-oil Camellia Resources of Hainan Island
文献类型:期刊文章
Qi Huasha;Chen Jiali;Yang Lirong;Sun Xiuxiu;Zheng Daojun;Yu Jing(College of Horticulture,Hainan University,Haikou,570228;Hainan Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Tropical Special Economic Plants,Tropical Horticuture Research Institute,Hainan Academy of Agricultural Sciences,Haikou,571100)
机构地区:[1]海南大学园艺学院,海口570228 [2]海南省农业科学院热带园艺研究所,海南省热带特种经济植物种质资源创新利用重点实验室,海口571100
基 金:国家自然科学基金项目(31860082);海南省省属科研院所技术开发专项(KYYS-2018-14)共同资助。
年 份:2020
卷 号:18
期 号:10
起止页码:3273-3281
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、ZGKJHX、核心刊
摘 要:海南岛为中国油茶资源分布的最南缘,海南油茶资源丰富,特色显著。本研究以海南油茶基因组DNA为模板,采用单因素试验和正交试验相结合的方法,分析DNA浓度、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶用量和引物浓度对海南油茶SRAP-PCR扩增结果的影响,构建海南油茶SRAP-PCR体系,对多态性引物组合进行筛选,为SRAP分子标记在海南油茶资源遗传多样性评价和鉴定提供条件。单因素试验结果表明:在本试验中,海南油茶基因组DNA浓度高低对扩增效率影响不大,低浓度dNTPs有利于获得较好的扩增产物,而中高浓度的Taq酶和引物可提高扩增效果。正交试验结果表明:在适宜浓度范围内,各因素对海南油茶SRAP-PCR扩增影响大小依次为:引物>dNTPs>Taq DNA聚合酶>模板DNA;总体系为20μL时,最佳反应体系中模板DNA用量为5 ng,dNTPs浓度为0.20 mmol/L,引物浓度为0.60μmol/L以及Taq DNA聚合酶用量为4.00 U。采用稳定SRAP-PCR体系,对400对SRAP引物进行筛选,获得32对多态性好、条带清晰的有效引物,可用于海南油茶遗传多样性分析和种质资源鉴定等研究。
关 键 词:海南油茶 SRAP-PCR 体系优化 引物筛选
分 类 号:S794.4]
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