期刊文章详细信息
贵州威宁红花油茶的叶绿体基因组特征分析
Characterization of Complete Chloroplast Genome of Camellia weiningensis in Weining,Guizhou Province
文献类型:期刊文章
LI Qian;GUO Qiqiang;GAO Chao;LI Huie(Department of horticulture,College of Agriculture,Guizhou University,Guiyang 550025,China;Institute for Forest Resources&Environment of Guizhou Province,Guizhou University,Guiyang 550025,China)
机构地区:[1]贵州大学农学院园艺系,贵阳550025 [2]贵州大学贵州省森林资源与环境研究中心,贵阳550025
基 金:贵州省生物学一流学科建设项目(GNYL[2017]009);国家自然科学基金项目(31800516);贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2019]2310,2314)。
年 份:2020
卷 号:47
期 号:4
起止页码:779-787
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:对威宁红花油茶(Camellia weiningensis)的叶片高通量测序数据进行叶绿体全基因组的组装和注释分析。其叶绿体全基因组长为156490 bp,包含典型的四分体结构,序列已登录GenBank(MK820035)。叶绿体全基因组比较分析表明,与其他山茶属物种一样,其结构与基因排序均保守,但在基因组的反向重复区边界处表现出明显区别。简单重复序列(SSR)分析表明,全基因组仅包含51个单核苷酸重复的SSR,且仅为A/T重复类型。系统发育分析表明,威宁红花油茶与腾冲红花油茶亲缘关系最近,但其所处分支包含的4个山茶属物种的分组与传统分类不一致。
关 键 词:威宁红花油茶 叶绿体基因组 系统发育
分 类 号:S68]
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