文献类型：期刊文章

作　　者：乔瑞娟[1] 陈建华[1] 武海卓[1] 张燕[2] 张慧[1] 汪鹏[1] 张入学[3] 李宇宁[4] 高强[5] 魏克敏[6] 于德山[1]

Qiao Ruijuan;Chen Jianhua;Wu Haizhuo;Zhang Yan;Zhang Hui;Wang Pengx;Zhang Ruxue;Li Ylining;Gao Qiang;Wei Kemin;Yu Deshan(Gansu Center for Disease Control and Prevention,Lanzhou 730000,China;N ational Institute for Viral Disease Control and Prevention,Chinese Center for Disease Control and Prevention,Beijing 102206,China;Baiyin Center for Disease Control and Prevention,Baiyin 730900,China;Department of Pediatrics,the first Hospital of Lanzhou University y Lanzhou 730000,China;Longnan Center for Disease Control and Prevention,Longnan 746000,China;Tianshui Center for Disease Control and Prevention,Tianshui 741000,China)

机构地区：[1]甘肃省疾病预防控制中心,兰州730000 [2]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京102206 [3]白银市疾病预防控制中心,730900 [4]兰州大学第一医院儿科,730000 [5]陇南市疾病预防控制中心,746000 [6]天水市疾病预防控制中心,741000

出　　处：《中华实验和临床病毒学杂志》

基　　金：国家科技重大专项(2017ZX10103006,2017ZX10104001);2015年甘肃省卫生行业科研计划(GSWSKY-2015-36)。

年　　份：2019

卷　　号：33

期　　号：6

起止页码：586-592

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的 了解甘肃省感染儿童中呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus, RSV)的基因分型和变异变迁情况,掌握RSV的分子流行特征,预测RSV的流行型别与基因型。方法 2012-2017年从甘肃兰州、白银、张掖、天水、陇南等5个市哨点医院共收集到4 556份10岁以下急性呼吸道感染住院患儿的标本。使用实时荧光PCR方法检测获得RSV阳性的标本。再使用RT-PCR方法扩增RSV阳性标本的G蛋白编码基因全长进行测序,用DNAStar和MEGA 6.0等生物信息学软件进行序列拼接、比对、基因亲缘性和氨基酸变异特点等分析。结果 荧光PCR法共检测出1 135份RSV阳性标本,总体阳性率为24.91%,其中共获得216条G蛋白序列;根据G蛋白第二高变区的靶基因特征分析,甘肃省2012-2017年间RSV A亚型流行基因型包括NA1、NA3和ON1,G蛋白编码全长序列核苷酸同源性为84.9%~100%,氨基酸同源性为77.3%~100%,与原型株long株的核苷酸和氨基酸同源性分别为81.2%~83.3%和74.1%~88.0%。RSV B亚型流行基因型为BA9,G蛋白编码全长序列核苷酸同源性为97.7%~100%,氨基酸同源性为95.8%~100%,与原型株CH18 537株的核苷酸和氨基酸同源性分别为84.9%~85.7%和77.9%~80.1%。结论 本研究系统分析了2012-2017年甘肃省5市RSV A、B亚型G蛋白编码基因特征及氨基酸变异情况,为RSV病原研究以及感染控制提供依据。

关 键 词：呼吸道合胞病毒 G蛋白 基因特征 分子流行  

分 类 号：R181.3] R725.6[公共卫生与预防医学类]