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期刊文章详细信息

基于网络药理学和分子对接法探索肺毒清治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在活性成分    

Exploration on active compounds of Feiduqing for treatment of COVID-19 based on network pharmacology and molecular docking

  

文献类型:期刊文章

作  者:刘钱[1] 贺桢翔[2] 杨慧[2] 刘新燕[2] 曾钦[2] 张梅[2] 刘涛[2]

LIU Qian;HE Zhen-xiang;YANG Hui;LIU Xin-yan;ZENG Qin;ZHANG Mei;LIU Tao(Sichuan Industrial Institute of Antibiotics,Chengdu University,Chengdu 610106,China;College of Pharmacy and Bioengineering,Chengdu University,Chengdu 610106,China)

机构地区:[1]成都大学四川抗菌素工业研究所,四川成都610106 [2]成都大学药学与生物工程学院,四川成都610106

出  处:《中草药》

基  金:四川省科学技术厅2020年省级科技计划项目(20YYJC1839);2020年成都龙泉驿区科技计划项目(新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控专项)。

年  份:2020

卷  号:51

期  号:7

起止页码:1713-1722

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的以网络药理学和分子对接法探索肺毒清治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)活性化合物。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)获得肺毒清中木蝴蝶、栀子及苦参3味中药相关的成分和作用靶点,通过Uni Prot数据库查询靶点对应的基因;采用STRING平台构建靶点PPI网络;通过DAVID进行GO(gene ontology)生物过程及KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析,对核心靶点进行网络拓扑分析,运用Cytoscape 3.7.0构建成分-靶点网络,分析预测其作用机制。肺毒清中核心化合物与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶进行分子对接,同时将结合能最低的前3位化合物与血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接。结果成分-靶点网络得到269个节点,4204条边,其中包括槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚等50个成分,关键靶点有JUN、AKT1、TP53、PTGS2、FOS、ESR1等。GO功能富集分析得到GO条目2 187个(P<0.05),其中生物过程(biological process,BP)条目1 877个,细胞组成(cellular component,CC)条目105个,分子功能(molecularfunction,MF)条目205个;KEGG富集筛选得到25条信号通路(P<0.05),主要有乙型肝炎通路、致癌通路、肿瘤坏死因子信号通路、胰腺癌、弓形虫病通路等;木犀草素(-26.78 kJ/mol)、槲皮素(-26.36kJ/mol)、去甲脱水淫羊藿黄素(-25.94 kJ/mol)作用于SARS-CoV-2 3CL水解酶的分子对接结合能最低。结论肺毒清的活性化合物通过作用于JUN、AKT1、TP53、PTGS2、FOS、ESR1等靶点,与ACE2结合,调节多条信号通路,对COVID-19有潜在治疗作用。

关 键 词:肺毒清  网络药理学  新型冠状病毒肺炎  严重急性呼吸综合征冠状病毒2  分子对接 血管紧张素转化酶Ⅱ  木犀草素 槲皮素 去甲脱水淫羊藿黄素  

分 类 号:R285[中药学类]

参考文献:

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耦合文献:

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引证文献:

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同被引文献:

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