文献类型：期刊文章

作　　者：刘妍如[1] 唐志书[1] 王梅[2] 段金廒[3] 宋忠兴[1] 周瑞[1] 王征[1] 李宏[4] 李晓红[1] 江大海[1]

LIU Yan-ru;TANG Zhi-shu;WANG Mei;DUAN Jin-ao;SONG Zhong-xing;ZHOU Rui;WANG Zheng;LI Hong;LI Xiao-hong;JIANG Da-hai(Shaanxi Collaborative Innovation Center of Chinese Medicinal Resources Industrialization,State Key Laboratory of Research and Development of Characteristic Resources of Qin Medicine Research,Shaanxi Institute of Chinese Medicine Industry Research,Shaanxi University of Chinese Medicine,Xianyang 712083,China;The Affiliated Hospital of Shaanxi University of Chinese Medicine,Xianyang 712083,China;Jiangsu Key Laboratory for Traditional Chinese Medical Formula Research,Collaborative Innovation Center of Chinese Medicinal Resources Industrialization of Jiangsu Province,Nanjing University of Chinese Medicine,Nanjing 210023,China;Pharmaceutical Factory of Shaanxi University of Traditional Chinese Medicine,Xianyang 712046,China)

机构地区：[1]陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心,秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育),陕西省创新药物研究中心,陕西咸阳712083 [2]陕西中医药大学附属医院,陕西咸阳712083 [3]南京中医药大学江苏省方剂高技术研究重点实验室,江苏省中药资源产业化过程协同创新中心,江苏南京210023 [4]陕西中医药大学制药厂,陕西咸阳712046

出　　处：《中草药》

基　　金：2020年度咸阳市重点研发计划“新型冠状病毒肺炎疫情应急防治”科技专项;陕西省三秦学者创新团队;陕西省“特支计划”青年拔尖人才项目(陕组通字[2018]33号)。

年　　份：2020

卷　　号：51

期　　号：7

起止页码：1694-1703

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的运用分子对接技术模拟预测TCMSP数据库中药成分对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶的作用。方法基于SARS-CoV-23CL水解酶的PDB晶型结构(6LU7),构建虚拟靶标模型,以TCMSP数据库中的13143个化合物为配体筛选对象,以6LU7原配体分子为对照,采用薛定谔2018软件,以Glide程序建立6LU7分子对接体系。然后以原配体分子的对接打分结果为阈值,口服生物利用度(OB)≥30%或类药性(DL)≥0.18为标准筛选候选化合物。最后建立“成分-药材-归经-功效”网络,对候选成分的主要药材归属和作用功效进行总结。结果按照对接打分、OB、DL筛选标准,共筛选得到60个化合物。受体-配体相互作用结果显示,候选化合物主要与靶点蛋白的GLU166、GLY143、ASP187、CYS145、GLN189和LEU141等发生氢键作用。网络预测结果显示,所筛选化合物主要归属药材为甘草、桑白皮、满山红、虎杖和车前草等,肺脏是作用的关键靶器官,其作用功效以清热解毒、止咳祛痰、泻肺平喘等为主。结论对TCMSP数据库化合物进行虚拟分子对接得到的结果为SARS-CoV-23CL水解酶抑制剂筛选提供了相关数据。

关 键 词：新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎  3CL水解酶  TCMSP数据库  分子对接

分 类 号：R285.5[中药学类]