文献类型：期刊文章

作　　者：师睿[1] 张毅[1] 王雅春[1] 黄涛[2] 卢国昌[3] 岳涛[4] 卢振西[3] 黄锡霞[5] 卫新璞[6] 冯书堂[7] 陈军[8] 乌兰·卡格德尔[8] 茹先古丽·阿不力孜[8] 努尔胡马尔·木合塔尔[8]

Rui Shi;Yi Zhang;Yachun Wang;Tao Huang;Guochang Lu;Tao Yue;Zhenxi Lu;Xixia Huang;Xinpu Wei;Shutang Feng;Jun Chen;Wulan Kagedeer;Ruxianguli Abulizi;Nuerhumaer Muhetaer(Key Laboratory of Animal Genetics,Breeding and Reproduction(MARA),National Engineering Laboratory for Animal Breeding,College of Animal Science and Technology,China Agricultural University,Beijing 100193,China;College of Animal Science and Technology,Xinjiang Shihezi University,Shihezi 832000,China;Xinjiang Jinshengwang Agriculture and Science Technology Co.,Ltd,Tacheng 834700,China;Livestock Science and Technology Research and Extension Center of Tangcheng Area,Tacheng 834700,China;College of Animal Science,Xinjiang Agricultural University,Urumqi 830052,China;Xinjiang Hutubi Cattle Farm Co.,Ltd,Changji 831100,China;Insititute of Animal Scienece,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100193,China;Animal Husbandry Service of Xinjiang Uygur Autonomous Region,Urumqi 830009,China)

机构地区：[1]中国农业大学动物科技学院,农业农村部动物遗传育种与繁殖(家畜)重点实验室,畜禽育种国家工程实验室,北京100193 [2]新疆石河子大学动物科学技术学院,石河子832000 [3]新疆锦盛旺农业科技有限公司,塔城834700 [4]新疆塔城地区畜牧科技研究推广中心,塔城834700 [5]新疆农业大学动物科学学院,乌鲁木齐830052 [6]新疆呼图壁种牛场有限公司,昌吉831100 [7]中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193 [8]新疆维吾尔自治区畜牧总站,乌鲁木齐830009

出　　处：《遗传》

基　　金：现代农业(奶牛)产业技术体系建设专项资金(编号:CARS-36);长江学者和创新团队发展计划项目(编号:IRT_15R62)资助。

年　　份：2020

卷　　号：42

期　　号：5

起止页码：493-505

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：新疆近交牛是经45年近亲繁育形成的近交群体,但由于繁育记录缺失,其原始亲本品种未知。为了明确新疆近交牛的遗传背景,并探索利用基因组信息评价牛群近交水平的可行性,本研究利用该群体及荷斯坦牛、新疆褐牛和哈萨克牛等16个国内外牛品种的SNP芯片数据,应用主成分分析和Admixture方法对塔城地区新疆近交牛的群体结构进行分析;通过进一步计算新疆近交牛、荷斯坦牛、新疆褐牛和哈萨克牛的群体遗传学参数以及基因组近交指标评估各群体近交程度;结合新疆近交牛的体型分类和基因组近交指标信息,探讨了个体近交程度与体型表现的关系;最后,基于对新疆近交牛和哈萨克牛高频长纯合片段区域的筛选,鉴定了新疆近交牛基因组特征区域。研究结果显示,新疆近交牛的遗传背景与哈萨克牛基本一致,近交牛基因组纯合程度明显高于其他群体,且基因纯合率越高的近交牛其体型越小,在一定程度上呈现了近交衰退对体型的影响。本研究还鉴定到与新疆近交牛基因组特征区域相关的6个基本生物学通路以及与重要经济性状相关的32个数量基因座(quantitative trait loci,QTL)。本研究结果为新疆近交牛这一特殊遗传资源的育种规划及未来该群体的开发利用提供了科学依据。

关 键 词：新疆近交牛  群体结构  基因组近交  长纯合片段  

分 类 号：S823]