文献类型：期刊文章

作　　者：邵继平[1] 谢学立[1] 刘莹[1] 郭燕子[1] 符健[1]

Shao Jiping;Xie Xueli;Liu Ying;Guo Yanzi;Fu Jian(Drug Preclinical Pharmacological Toxicology Key Laboratory,Hainan Medical University)

机构地区：[1]海南医学院海南省药物临床前药理毒理学研究重点实验室,海口571199

出　　处：《重庆医科大学学报》

基　　金：海南省科技厅社会发展资助项目(编号:ZDYF2016126)。

年　　份：2020

卷　　号：45

期　　号：2

起止页码：234-238

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的:对HIV-1 gp41蛋白的膜外区和跨膜区进行预测,并分析该蛋白的结构和功能。方法:从NCBI GenBank数据库获取gp41基因及其蛋白编码序列,利用ExPASy ProtParam tool、ProtScale、SignalP 4.0 Server、TMHMM Server v.2.0、SWISSMODEL、PredictProtein等工具对gp41蛋白的生物学特性进行预测。结果:HIV-1 gp41基因ORF长度为666 bp,编码222个氨基酸,蛋白分子式为C1164H1815N317O325S6,等电点(isoelectric point,pI)=8.60,属于稳定、疏水性蛋白。该蛋白具有跨膜区,信号肽切割位点位于第20和21位氨基酸处。其二级结构由无规则卷曲、β折叠和α螺旋组成,属于全螺旋型蛋白。而且该蛋白具有N-端信号肽,能引导蛋白分泌到胞外。此外gp41蛋白具有4个蛋白质-蛋白质和1个蛋白质-核酸结合位点,这些位点能调控gp41蛋白的多种生物学功能。结论:对gp41蛋白的结构和功能进行了预测,为深入研究其参与疾病发生发展的分子机制奠定了基础。

关 键 词：HIV-1 包膜糖蛋白gp41  CRF01_AE毒株  生物信息学预测

分 类 号：R373]