文献类型：期刊文章

作　　者：管泽雨[1] 邱嘉迪[1] 刘文硕[1] 赵蕴杰[1]

GUAN Zeyu;QIU Jiadi;LIU Wenshuo;ZHAO Yunjie(College of Physical Science and Technology, Central China Normal University, Wuhan 430079, China)

机构地区：[1]华中师范大学物理科学与技术学院生物物理研究所,武汉430079

出　　处：《华中师范大学学报（自然科学版）》

基　　金：华中师范大学中央高校基本科研业务费项目(CCNU19QD008).

年　　份：2020

卷　　号：54

期　　号：2

起止页码：237-243

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2019_2020、IC、JST、MR、PUBMED、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZMATH、ZR、核心刊

摘　　要：蛋白质残基相互作用网络对理解蛋白质的结构特征,生物学功能和结合位点预测等研究有重要的作用.然而,现有的蛋白质残基相互作用分析方法易用性较差,需要下载和安装程序,较少提供友好易用的网络可视化功能,极大限制了蛋白质结构、功能和药物设计的相关研究.建立了蛋白质残基相互作用网络在线服务及可视化计算平台(http://renault.fun),用户不需要下载和编写程序,仅需上传蛋白质结构数据和口袋相关信息即可搭建蛋白质残基相互作用网络,并实现度中心度(degree centrality),接近中心度(closeness centrality)和中介中心度(betweenness centrality)等网络特征的计算.该计算平台可进一步实现蛋白质残基相互作用网络的可视化,分析蛋白质表面结合口袋的网络特性,对理解蛋白质结构和药物设计的相关应用研究有较大的帮助.

关 键 词：力导向算法  网络可视化 在线服务  D3.js  

分 类 号：R857.3]