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期刊文章详细信息

阿拉伯岩芥AP2基因家族的生物信息学分析    

Bioinformatics Analysis of AP2 Gene Family in Aethionema arabicum

  

文献类型:期刊文章

作  者:付春[1,2] 刘晓伟[1,2] 王玲[1,2] 江纳[3] 杨瑶君[1,2]

FU Chun;LIU Xiao-wei;WANG Ling(Sichuan Key Laboratory of Bamboo Disease and Pests Control and Resources Development,Leshan Normal University,Leshan,Sichuan 614000;College of Life Science,Leshan Normal University,Leshan,Sichuan 614000)

机构地区:[1]乐山师范学院竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室,四川乐山614000 [2]乐山师范学院生命科学学院,四川乐山614000 [3]乐山师范学院数学与信息科学学院,四川乐山614000

出  处:《安徽农业科学》

基  金:四川省科技厅项目(17ZZ019);乐山师范学院人才启动项目(XJR17005)。

年  份:2020

卷  号:48

期  号:8

起止页码:114-123

语  种:中文

收录情况:CAS、JST、RCCSE、普通刊

摘  要:AP2基因作为一种调控植物花发育的功能基因,参与花分生特性建立。利用生物信息学方法对阿拉伯岩芥AP2蛋白的理化性质、高级结构和系统进化关系等进行了详细的预测和分析。结果表明,除了成员AA40G00375、AA54G00162为稳定蛋白,其余AP2蛋白均为不稳定蛋白,且大多数蛋白定位在细胞核。只有成员AA8G00350属于分泌蛋白,其余均为非分泌蛋白,且均不属于跨膜蛋白。磷酸化位点分析表明AP2蛋白的生物功能主要是通过在丝氨酸(Ser)位点进行磷酸化来实现的。AP2蛋白的二级结构以无规则卷曲为主,各个成员的二级结构元件组成含量大小排列顺序为无规则卷曲>α-螺旋>延伸链>β-转角。其中14个AP2蛋白成员有2个保守结构域,其余均有1个保守结构域。系统进化树表明阿拉伯岩芥AP2基因家族与拟南芥、小麦有较近的亲缘关系。这些结果可为进一步研究其生物学功能提供一定的参考依据。

关 键 词:阿拉伯岩芥  AP2基因  生物信息学

分 类 号:Q943.2[植物生产类]

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