期刊文章详细信息
基于高通量分子对接虚拟筛选SARS-CoV-23CL水解酶中药小分子抑制剂及抗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的中药及其复方预测
Virtual screening of small molecular inhibitors of SARS-CoV-23CL hydrolase based on high-throughput molecular docking and prediction of Chinese materia medica and its compound against COVID-19
文献类型:期刊文章
MA Qing-yun;LIU Chen;DU Hai-tao;ZHANG Gui-sheng;YAN Bin;SUN Qi-hui;LIU Xiao-yun;QI Dong-mei;YANG Yong;RONG Rong(School of Pharmacy,Shandong University of Traditional Chinese Medicine,Jinan 250355,China;School of Technology,Shandong University of Traditional Chinese Medicine,Jinan 250355,China;Experimental Center,Shandong University of Traditional Chinese Medicine,Jinan 250355,China;Collaborative Innovation Center for Antiviral Traditional Chinese Medicine in Shandong Province,Jinan,250355,China)
机构地区:[1]山东中医药大学药学院,山东济南250355 [2]山东中医药大学理工学院,山东济南250355 [3]山东中医药大学实验中心,山东济南250355 [4]山东省高校中医药抗病毒协同创新中心,山东济南250355
基 金:国家自然科学基金资助项目(81873220);国家自然科学基金资助项目(81774167);山东省重点研发计划(2018CXGC1307)。
年 份:2020
卷 号:51
期 号:6
起止页码:1397-1405
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、IPA、JST、RCCSE、RSC、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的基于中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP,运用计算机虚拟筛选技术寻找新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶的中药小分子抑制剂,推测潜在抗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)中药及中药复方。方法以SARS-CoV-23CL水解酶蛋白为靶点,利用Autodock Vina软件和Python脚本实现高通量分子对接,结合"ADME-Lipinski"规则进行再次筛选,以优选活性成分,推测关键中药及复方。基于网络药理学角度,构建成分-靶点-通路网络,推测核心药对的作用机制。结果以SARS-Co V-2原配体为阳性对照,筛选出66个药动学性质良好的天然小分子抑制剂,优选出12味中药单味药,2个中药药对甘草-桑白皮和金银花-连翘,以及桑菊饮、桑菊饮合银翘散加减等12个中药处方作为抗SARS-CoV-2的候选方案。结论基于高通量分子对接技术虚拟筛选SARS-CoV-23CL水解酶的中药小分子抑制剂及中药,结合网络药理学分析潜在分子机制,为中药抗击SARS-Co V-2提供了科学指导与理论依据。
关 键 词:分子对接 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 3CL水解酶 中药小分子抑制剂 网络药理学 甘草-桑白皮 金
分 类 号:R285.5[中药学类]
参考文献:
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引证文献:
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同被引文献:
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