期刊文章详细信息
基于16SrDNA测序技术分析重症肺炎患者肠道菌群的变化
Analysis of intestinal patients'flora changes with severe pneumonia based on 16SrDNA sequencing technology
文献类型:期刊文章
Zhang Xiaoya;Yang Xiaojuan;Zhang Zhenqi;Lei Mengmeng;Zhang Xiaobin;Wang Xiaohong;Yang Xiaojun(Department of Intensive Care Unit,General Hospital of Ningxia Medical University,Yinchuan 750004,Ningxia Hui Autonomous Region,China;China University of Mining and Technology Yinchuan College,Yinchuan 750011,Ningxia Hui Autonomous Region,China;Ningxia Medical University,Yinchuan 750004,Ningxia Hui Autonomous Region,China)
机构地区:[1]宁夏医科大学总医院重症医学科,银川750004 [2]中国矿业大学银川学院,750011 [3]宁夏医科大学,银川750004
基 金:宁夏自然科学基金(2018AAC03151);十三五国家重点研发计划项目(2016YFD0400605);宁夏回族自治区教育厅科研项目(NGY2018-268)。
年 份:2019
卷 号:31
期 号:12
起止页码:1479-1484
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的用16SrDNA测序技术分析重症肺炎患者肠道菌群变化的特征.方法采用前瞻性研究方法,收集2018年6月至12月住宁夏医科大学总医院重症医学科(ICU)16例重症肺炎患者入院2 d内自然排便或灌肠所得的粪便标本,以及10例健康体检者的粪便标本,采用16SrDNA测序技术对粪便菌群进行检测并进行生物学信息分析.结果①对重症肺炎患者和健康者粪便样本进行16SrDNA测序共得到1015475条有效序列,样本序列平均有效长度为458.35 bp,总样本平均序列条数为39056.73条.②肠道菌群α多样性分析显示,与健康对照组比较,重症肺炎组患者肠道菌丰度指数Ace指数、Chao指数及肠道菌群多样性指数Shannon指数显著下降〔Ace指数:167.23(143.14,211.26)比227.71(214.53,247.05),Chao指数:152.38(138.09,182.54)比228.25(215.49,248.95),Shannon指数:2.37(1.68,2.89)比3.39(3.03,3.63),均P<0.01〕,肠道菌群多样性指数Simpson指数显著升高〔0.21(0.11,0.33)比0.07(0.06,0.12),P<0.01〕,提示重症肺炎患者肠道菌群的丰度和多样性下降.③肠道菌群β多样性分析(采用主坐标分析)显示,健康对照组菌群结构相似度高,重症肺炎组菌群结构差异较大.Adonis分析显示,重症肺炎组与健康对照组菌群群落结构存在显著差异(R2=0.061,P=0.05).④门水平差异菌分析显示,重症肺炎组厚壁菌门比例较健康对照组显著下降〔27.36(18.12,39.28)%比52.25(38.36,63.82)%,P=0.02〕,而放线菌门、互养菌门和梭杆菌门的比例均较健康对照组明显增加〔2.30(0.30,4.80)%比0.02(0.00,0.06)%,0.36(<0.01,0.57)%比<0.01(<0.01,<0.01)%,0.01(<0.01,0.08)%比<0.01(<0.01,<0.01)%,均P<0.05〕.⑤属水平差异菌分析显示,重症肺炎组有益共生菌属双歧杆菌属、瘤胃球菌属、假丁酸弧菌属、粪球菌属、毛螺菌属、普氏菌属比例均较健康对照组显著下降〔0.18(0.01,0.25)%比3.40(0.46,5.78)%,0.01(<0.01,0.29)%比2.26(0.84,4.86)%,0.01(<0.01,0.02)%比2.73(1.87,5.74)%,0.02(<
关 键 词:重症肺炎 16SrDNA 肠道菌群 肠道微生态 菌群多样性
分 类 号:R563]
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