期刊文章详细信息
69份苦玄参种质SSR遗传多样性及品质性状相关标记分析
SSR-based Analysis of Genetic Diversity and Quality Trait-related Markers of 69 Picria felterrae Germplasm Samples
文献类型:期刊文章
YAN Guo-yue;YANG Fan;BAI Yan-yuan;LI Yao-yan;WU Meng-li;GAO Hui;ZHANG Miao;BORJIGIDAI Almaz;XIE Yang-jiao(Key Laboratory of Ethnomedicine,Ministry of Education,School of Pharmacy,Minzu University of China,Beijing 100081,China;College of Yao Medicine,Guangxi University of Chinese Medicine,Nanning 530001,China;Guangxi Talent Highland for Zhuang and Yao Medicine and Combination of Medical Care and Elderly Care,Nanning 530001,China;Guangxi Center for Zhuang and Yao Medicine Engineering and Technology Research,Nanning 530200,China;Guangxi Key Laboratory of Zhuang and Yao Ethnic Medicine Collaborative Innovation Center of Zhuang and Yao Ethnic Medicine,Nanning 530200,China)
机构地区:[1]中央民族大学民族医药教育部重点实验室,药学院,北京100081 [2]广西中医药大学瑶医药学院,南宁530001 [3]广西壮瑶医药与医养结合人才小高地,南宁530001 [4]广西壮瑶药工程技术研究中心,南宁530200 [5]广西壮瑶药重点实验室(壮瑶药协同创新中心),南宁530200
基 金:国家自然科学基金项目(31460074,81573535);国家重点研发计划项目(2017YFC1704000);民族医药教育部重点实验室自主课题(KLEM-ZZ201805);广西壮瑶药重点实验室项目(桂科基字【2014】32号);壮瑶药协同创新中心项目(桂教科研【2013】20号)。
年 份:2020
卷 号:26
期 号:4
起止页码:174-184
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的:采用简单重复序列(SSR)分子标记技术对广西苦玄参主产区69份苦玄参种质样本进行遗传多样性及亲缘关系分析,并筛选与苦玄参苷含量相关联的优良种质基因。为苦玄参种质资源评价、遗传进化分析及分子标记辅助育种等提供依据。方法:基于转录组测序技术,开发20对引物进行批量扩增。利用各标记位点的遗传多态信息,分析69份苦玄参种质的遗传多样性及亲缘关系,并通过一元线性和多元逐步回归分析,筛选与苦玄参苷含量相关联的分子标记。结果:20对SSR引物共扩增出76个等位基因,平均每个位点观测等位基因3.8个,高于有效等位基因数(1.9692个),稀有等位基因率为38.2%,等位基因分布不均匀。等位基因多态率范围为0~59%,平均38.24%,各位点多态率差异较大。各位点多态信息含量(PIC)变化范围为0~0.6211,平均0.3780;Shannon多态性信息指数变化范围为0~1.2401,平均0.7590;Nei’s基因多样性指数(Nei)变化范围为0~0.6823,平均0.4409;以上3个指标最高的为P21,最低为P7,各位点遗传多样性存在较大差异。各位点平均观测杂合度为0.3824,低于平均期望杂合度(0.4425),表现为杂合子缺失;平均遗传分化系数Fst为0.3659;基因流Nm平均值为0.4332,种质遗传分化较大,基因流较小。一元线性回归分析和多元逐步回归分析结果表明,与苦玄参苷IA和IB相关的位点各有5个,其中仅有1个位点与2个成分的含量均相关。结论:20个SSR标记位点遗传多样性存在较大的差异,供试69份种质遗传分化大,基因流较小;从供试20个SSR标记中筛选出9个与苦玄参苷含量相关联的标记位点,试验结果可为苦玄参遗传进化分析及良种选育和繁育等提供依据。
关 键 词:苦玄参 简单重复序列(SSR)分子标记 遗传多样性 品质性状 相关分析
分 类 号:R284.2[中药学类] R289[中医学类]
参考文献:
正在载入数据...
二级参考文献:
正在载入数据...
耦合文献:
正在载入数据...
引证文献:
正在载入数据...
二级引证文献:
正在载入数据...
同被引文献:
正在载入数据...