文献类型：期刊文章

作　　者：刘彬[1,2] 沈林園[1,2] 陈映[1,3] 李强[3] 廖坤[4] 郭芝忺[1,2] 张顺华[1,2] 朱砺[1,2]

LIU Bin;SHEN Linyuan;CHEN Ying;LI Qiang;LIAO Kun;GUO Zhixian;ZHANG Shunhua;ZHU Li(College of Animal Science and Technology,Sichuan Agricultural University,Chengdu 611130,China;Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province,Sichuan Agricultural University,Chengdu 611130,China;Sichuan Animal Husbandry Station,Chengdu 610041,China;Tongjiang County Animal Husbandry Station,Tongjiang 636700,China)

机构地区：[1]四川农业大学动物科技学院,成都611130 [2]四川农业大学“畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室”,成都611130 [3]四川省畜牧总站,成都610041 [4]通江县畜牧站,通江636700

出　　处：《畜牧兽医学报》

基　　金：国家重点研发计划项目(2018YFD0501004);四川省科技支撑项目(2016NYZ0050);国家现代农业产业技术体系四川生猪创新团队项目(SCSZTD-3-008);四川省畜牧总站畜禽遗传资源保护项目。

年　　份：2020

卷　　号：51

期　　号：2

起止页码：260-269

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：为了更好地了解青峪猪在世代更替过程中遗传结构的变化,更好的保护和利用青峪猪遗传资源,本研究利用50K SNP芯片,对青峪猪保种群内141头(26头公猪,115头母猪)健康成年个体进行SNP测定,通过多种分析软件对青峪猪保种群体和各个世代进行系谱校正,进而实施群体遗传多样性、遗传距离以及遗传结构变化等分析。结果显示,该封闭保种群由3个重叠世代构成,群体有效含量为12头,且整个群体可以分为6个含有公猪的家系和1个不含公猪的家系。其中,第3世代的有效群体含量最少,仅为3头,多态性标记比例随着世代的增加不断下降;141头青峪猪的平均遗传距离为(0.2604±0.0252),26头种公猪的遗传距离为(0.2633±0.0237)。随着繁殖世代的增加,各世代群体的遗传距离有轻微的上升趋势,部分种猪之间的亲缘关系和遗传距离较近;在141头青峪猪群体中共检测到1481个基因组上长纯合片段(runs of hemozygosity,ROH),78.01%的长度在200 Mb以内,基于ROH值计算的近交系数表明整个群体的平均近交系数为0.055,且各世代的近交系数在不断上升,到第3世代时已经达到了0.075。综上所述,通过对青峪猪分子水平的群体遗传结构研究表明,该保种群体在闭锁的继代繁育过程中存在群体遗传多样性损失,需要加强选配或导入外血以确保青峪猪遗传资源的长期保存。

关 键 词：SNP芯片  青峪猪  群体遗传结构

分 类 号：S828.2]