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期刊文章详细信息

基于16S rRNA高通量测序技术分析草原红牛瘤胃微生物多样性和功能预测的研究    

Analysis of microbial diversitythe rumen of Grassland Red cattle and prediction of the function of the microbes based on the16S rRNA high-throughput sequencing technology

  

文献类型:期刊文章

作  者:吴琼[1] 王思珍[1] 张适[1] 张丽媛[1] 胡宗福[1] 尤欢[2] 牛化欣[1]

WU Qiong;WANG Sizhen;ZHANG Shi;ZHANG Liyuan;HU Zongfu;YOU Huan;NIU Huaxin(College of Animal Science and Technology,Inner Mongolia University for Nationalities,Tongliao 028000,China;Inner Mongolia Tongliao City Livestock Breeding Guidelines Stand,Tongliao 028000,China)

机构地区:[1]内蒙古民族大学动物科学技术学院,内蒙古通辽028000 [2]通辽市家畜繁育指导站,内蒙古通辽028000

出  处:《畜牧与兽医》

基  金:内蒙古自治区自然基金(2017MS0342,2018MS03022,2018LH03013);内蒙古自治区科技创新引导项目;内蒙古自治区“草原人才”工程青年创新人才第一层次培养(Q2017022)和优质肉牛生产核心技术研究与示范创业人才团队项目;校地合作奈曼旗专项(SXZX2016002);内蒙古民族大学研究生科研立项(NMDSS1862)。

年  份:2020

卷  号:52

期  号:1

起止页码:62-67

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、ZGKJHX、核心刊

摘  要:为系统探讨草原红牛瘤胃内的微生物多样性及其功能,本试验利用16S rRNA基因高通量测序技术检测分析草原红牛(20月龄左右,均重为577.5 kg)瘤胃液样本菌群结构并进行PICRUSt功能预测。结果显示:通过Illumina Miseq测序平台共获得35 848条优质序列,聚类分析得到387个操作分类单元(OTU),经分类学鉴定分属15个门、20个纲、25个目、41个科及110个属;厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)为优势菌群,所占比例分别为50.09%和41.11%;基于属的组成,依次为普雷沃菌属(Prevotella)15.20%、未知属f型拟杆菌目(norankfBacteroidales)BS11菌群8.66%、瘤胃菌科(Ruminococcaceae)NK4A214菌群6.96%、理研菌科(Rikenellaceae)RC9菌群5.56%、未知属(Christensenellaceae)R-7菌群4.01%、瘤胃球菌属2(Ruminococcus2)3.33%等;16S rRNA基因组的PICRUSt功能预测结果显示,瘤胃内菌群功能主要集中在碳水化合物转运及代谢,表面草原红牛体内含有大量的纤维素和木质素降解酶基因。综上,基于16S rRNA基因的高通量测序技术全面揭示了草原红牛瘤胃菌群的多样性,且预测其含有丰富的蛋白质分解、木质纤维素降解酶系,为探索草原红牛瘤胃微生物的认知提供了基础,也为挖掘其他重要营养生理功能相关的瘤胃微生物功能基因提供了参考。

关 键 词:草原红牛 瘤胃微生物 16S  RRNA 功能预测  

分 类 号:S823]

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