文献类型：期刊文章

作　　者：周烨真[1] 张世豪[1] 陈嘉仪[1] 万成松[1] 赵卫[1] 张宝[1]

ZHOU Yezhen;ZHANG Shihao;CHEN Jiayi;WAN Chengsong;ZHAO Wei;ZHANG Bao(Biosafety Level-3 Laboratory,School of Public Health,Southern Medical University,Guangzhou 510515,China)

机构地区：[1]南方医科大学公共卫生学院三级生物安全实验室

出　　处：《南方医科大学学报》

基　　金：国家自然科学基金(31670168)~~

年　　份：2020

卷　　号：40

期　　号：2

起止页码：152-158

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的分析新型冠状病毒SARS-CoV-2的进化、变异情况。方法从GISAID、NCBI中下载相关病毒全基因组序列,运用生物信息学软件MEGA-X、BEAST、TempEst等软件,构建基因组进化树,推测病毒的时间进化信号,计算病毒出现的tMRCA时间,分析病毒进化的选择压力。结果基因组进化树显示SARS-CoV-2与蝙蝠冠状病毒Beta CoV/bat/Yunnan/RaTG13/2013、bat-SL-CoVZC45、bat-SL-CoVZXC21和SARS-CoV等病毒共同构成冠状病毒β属的Sarbecovirus亚属。现在的病毒序列有微弱的时间进化信号,tMRCA平均时间为73 d,95%可信区间(38.9~119.3 d),与BetaCoV/bat/Yunnan/RaTG13/2013病毒不具正性时间进化信号,与bat-SL-CoVZC45和SARS-CoV具有强的正性时间进化关系。病毒在流行期间存在变异,主要是净化选择压力。结论病毒SARS-CoV-2可能出现在2019年11月左右,来源于蝙蝠相关冠状病毒。结果将有助于研究病毒SARS-CoV-2的溯源、进化,对疾病进行正确防控具有指导意义。

关 键 词：SARS-CoV-2  冠状病毒 进化 变异  

分 类 号：R373]