文献类型：期刊文章

作　　者：王晖[1] 谢岩[1] 孙志超[1] 高玉军[1] 张东豪[1] 宋永学[1] 高妍夏[1]

Wang Hui;Xie Yan;Sun Zhichao;Gao Yujun;Zhang Donghao;Song Yongxue;Gao Yanxia(Applied Technology R&D Center of Sericulture and Specialty of Hebei Universities,Institute of Sericulture of Chengde Medical University,Chengde,067000)

机构地区：[1]承德医学院蚕业研究所河北省高校特产蚕桑应用技术研发中心

出　　处：《分子植物育种》

基　　金：河北省自然科学基金资助项目-青年科学基金(C2018406033);承德医学院高层次人才科研启动基金(201604)和承德医学院青年基金(201823)共同资助

年　　份：2020

卷　　号：18

期　　号：1

起止页码：208-215

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：采用转录组测序技术对三个时期的桑葚进行转录组测序,建立桑葚的EST数据库。基于生物信息学方法分析桑葚转录组数据库的简单重复序列位点。从51895条Unigenes中共检索出23641条Unigenes含有44867个简单重复序列位点,共计252种基序类型。在所有基序类型中,以A/T与AT/AT型出现次数最多。单核苷酸基序类型与二核苷酸基序类型出现频率最高,共计75.69%。基序长度以10~20 bp为主,重复次数集中5~18次。设计27149对引物,随机选择20对引物,通过PCR验证,在4个桑树品种中展现出良好的重现性与通用性。桑葚转录组SSR位点类型丰富,具备开发出适宜于果桑选育的分子标记的潜力。

关 键 词：桑葚(Morus alba L.)  转录组 简单重复序列位点  

分 类 号：S888.2]