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期刊文章详细信息

舟山近海水样环境DNA获取方法的建立    

THE EDNA COLLECTION METHOD OF ZHOUSHAN COASTAL WATERS

  

文献类型:期刊文章

作  者:陈治[1] 宋娜[2] 源利文[3] 邬倩倩[3] 高天翔[4]

CHEN Zhi;SONG Na;MINAMOTO Toshifumi;WU Qian-Qian;GAO Tian-Xiang(College of Fisheries and Life Science,Hainan Tropical Ocean University,Sanya 572022,China;Fisheries Collage,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;Graduate School of Human Development and Environment,Kobe University,Kobe 657-8501,Japan;Fisheries College,Zhejiang Ocean University,Zhoushan 316022,China)

机构地区:[1]海南热带海洋学院水产与生命学院,三亚572022 [2]中国海洋大学水产学院,青岛266003 [3]神户大学人间发达环境学研究科,神户657-8501 [4]浙江海洋大学水产学院,舟山316022

出  处:《水生生物学报》

基  金:国家自然科学基金(41776171和41806180)资助~~

年  份:2020

卷  号:44

期  号:1

起止页码:50-58

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘  要:以曼氏无针乌贼(Sepiella japonica)为研究对象,通过绝对定量技术建立和优化了舟山近海高浊度水样环境DNA(Environmental DNA,eDNA)的获取方法。研究结果如下:(1)同体积水样采用乙醇沉淀法获得的eDNA产量是滤膜抽滤法的1.76—2.53倍,但在实际应用中由于受到采样体积、处理方式、配套设备的限制,乙醇沉淀法难以发挥出优势;(2)滤网对泥沙等杂质无过滤作用,添加滤网并不能过滤掉泥沙及增加抽滤体积;(3)滤膜孔径的大小对少量水样的eDNA产量有很大影响,但对大体积水样eDNA的产量无影响;(4)水样静置处理有可能会增大eDNA产量,但也有可能会增大eDNA结果的波动性,使生物量评估结果误差较大;(5)阳离子表面活性剂对eDNA降解有明显的抑制作用;(6)去膜法效果优于碎膜法,建议使用去膜法进行eDNA消化,使用时增加离心时间;(7)酚抽除沙法虽然不能提高eDNA产量,但能明显提高产物纯度。研究首次建立了舟山近海水样大生物eDNA最适获取方法,为相似水域的水样采集及eDNA提取提供了借鉴参考。

关 键 词:环境DNA  获取方法  曼氏无针乌贼 舟山近海水域  

分 类 号:S931.4] Q-33[水产类]

参考文献:

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二级参考文献:

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耦合文献:

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引证文献:

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同被引文献:

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