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期刊文章详细信息

基于无标记荧光共振能量转移的microRNA检测方法研究  ( EI收录)  

Label-Free Detection of MicroRNA Based on Fluorescence Resonance Energy Transfer

  

文献类型:期刊文章

作  者:张文月[1] 郝文会[1] 赵静[2] 王愈聪[1]

ZHANG Wen-yue;HAO Wen-hui;ZHAO Jing;WANG Yu-cong(Key Laboratory of Medicinal Chemistry and Molecular Diagnosis,Ministry of Education,College of Chemistry and Environmental Science,Hebei University,Baoding 071002,China;Comprehensive Experimental Center,Hebei University,Baoding 071002,China)

机构地区:[1]河北大学化学与环境科学学院,药物化学与分子诊断省部共建教育部重点实验室,河北保定071002 [2]河北大学综合实验中心,河北保定071002

出  处:《光谱学与光谱分析》

基  金:国家自然科学基金项目(21605034)资助

年  份:2020

卷  号:40

期  号:1

起止页码:131-135

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EI、IC、INSPEC、JST、PUBMED、RCCSE、RSC、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:利用以阳离子共轭聚合物为能量供体的荧光共振能量转移(FRET)策略和滚环扩增放大技术,建立了一种新型的microRNA(miRNA)检测方法。阳离子共轭聚合物采用聚[(9,9-双(6’-N,N,N-三乙基铵)己基)亚芴基亚苯基二溴化物](PFP)。PFP是一种由大量吸光单元共轭而成的阳离子聚合物,具有独特的光捕获和荧光增强性能,可以和带有负电荷的DNA通过静电作用相互结合。SG是一种能够结合于所有双链DNA双螺旋小沟区域的染料,其在游离状态下,荧光微弱,但一旦与双链DNA结合后,荧光会大大的增强。首先,设计了一条可与目标分子特异性杂交的锁式探针和与RCA产物序列互补的DNA链。当体系中存在miRNA时,在T4 DNA连接酶作用下,锁式探针连接成环;随后,在phi29 DNA聚合酶和dNTPs共同作用下,在miRNA的3’端滚环扩增出一条与锁式探针序列互补的长单链DNA,所得产物与互补DNA链杂交形成双链DNA(dsDNA)。此时SG作为FRET受体掺入其中,形成SG-dsDNA共同体。随后, SG-dsDNA与PFP因静电相互作用而紧密接近,由于PFP的发射光谱与SG的激发光谱有重叠,因此二者之间可以发生FRET现象。反之,当体系中不存在miRNA时,挂锁探针则无法连接成环,阻止了扩增反应的进行及其产物与互补DNA链的杂交反应。加入SG后,由于SG与单链DNA的结合能力很弱, SG则游离于溶液中,不会与PFP发生有效的FRET。因此目标分子的浓度与体系的FRET效率直接相关。以let 7a作为待测miRNA分子,在0.05~5 nmol·L-1的范围内, let 7a的浓度与从反应体系测得的FRET效率(I520/I423)成正比。同时以无PFP参加的检测方案作为对比实验,证明了PFP确实具有提高灵敏度的作用。另外,以四种同族miRNA分子及两种其他miRNA分子作为干扰物质对方法的特异性进行了考察,发现除了两种与目标分子序列高度相似的物质存在干扰外,其他物质几乎不产生信号。利用该方法对细胞总RN

关 键 词:无标记 MICRORNA 荧光共振能量转移

分 类 号:O657.3]

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