文献类型：期刊文章

作　　者：王鹏良[1,2] 吴双成[2] 杨利平[3] 王华宇[2] 陈乃明[3] 张照远[1]

WANG Pengliang;WU Shuangcheng;YANG Liping;WANG Huayu;CHEN Naiming;ZHANG Zhaoyuan(Guangxi Key Laboratory of Superior Timber Trees Resource Cultivation,Guangxi Forestry Research Institute,Nanning 530002,China;Guangxi Key Laboratory of Beibu Gulf Marine Biodiversity Conservation,Beibu Gulf University,Qinzhou 535011,Guangxi,China;Qinzhou Key Laboratory of Plant Biotechnology,Qinzhou Forestry Research Institute,Qinzhou 535099,Guangxi,China)

机构地区：[1]广西优良用材林资源培育重点实验室,广西壮族自治区林业科学研究院,南宁530002 [2]广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室,北部湾大学,广西钦州535011 [3]钦州市植物生物技术重点实验室,广西钦州市林业科学研究所,广西钦州535099

出　　处：《广西植物》

基　　金：广西科技重大专项项目(桂科AA17204087-3);广西主要用材林资源高效培育与利用人才小高地专项项目(桂财社函[2018]112号);广西优良用材林资源培育重点实验室自主项目(14-A-03-01);广西优良用材林资源培育重点实验室开发课题(12A0301);钦州市科学研究与技术开发项目(20137003)~~

年　　份：2019

卷　　号：39

期　　号：12

起止页码：1583-1592

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2019_2020、IC、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：该文针对巨桉叶绿体基因组序列,选取其中长于300 nt且以AUG为起始密码子的43个非重复基因作为研究对象,采用CodonW1.4.2软件分析巨桉叶绿体基因组的密码子使用偏好性。结果表明:第3位密码子的平均GC含量为27.97%;ENC的变化范围为39.49~61.00,平均为47.04;RSCU>1的密码子有31个,其中29个以A/U结尾;中性分析显示,GC12与GC3无显著相关;回归分析未达到显著性水平;ENC-plot分析发现,大部分基因落在曲线上或附近;对应分析表明第1轴的贡献率为17.68%,第2轴的贡献率为11.49%,第3轴、第4轴的贡献率分别为8.00%和5.76%,前4轴累计贡献率达42.93%,第1轴与GC、ENC、CAI达到极显著相关。上述分析结果表明,巨桉叶绿体基因组的密码子偏好较弱,密码子第3位偏好以A或U结尾,选择和突变在巨桉叶绿体基因组密码子偏好中起相对均衡的作用,最终确定UUG、CUU、GUU、UCC、UCA、ACA、UAU、UAA、CAU、AAU、AGA和GGA 12个高频高表达密码子为最优密码子。这为转化叶绿体基因密码子优化,提高表达效率和改良巨桉目标性状奠定了坚实基础。

关 键 词：巨桉 叶绿体 基因组 密码子偏好性

分 类 号：Q945.4[植物生产类]