期刊文章详细信息
基于高通量技术的唐古特大黄叶绿体全基因组测序及应用研究
High-throughput sequencing of complete chloroplast genome of Rheum tanguticum and its application in species identification
文献类型:期刊文章
ZUO Wen-ming;ZENG Yang;YANG Chun-fang;Li Mei-ju;LI Jin-ping;LIU Li-kuan(Qinghai Key Laboratory of Medicinal Animal and Plant Resources in Qinghai-Tibetan Plateau,College of Biological Science,Qinghai Normal University,Xining 810008,China)
机构地区:[1]青海师范大学生命科学学院青海省青藏高原药用动植物资源重点实验室,青海西宁810008
基 金:国家自然科学基金资助项目(31360068);青海省科技厅自然基金项目(2017-ZJ-742);教育部春晖计划(Z2019070);本科生科技创新项目(qhnuxskj2019014)。
年 份:2019
卷 号:50
期 号:22
起止页码:5545-5553
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、IPA、JST、RCCSE、RSC、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的获得野生唐古特大黄叶绿体全基因组信息特征,并对相关物种亲缘关系进行研究。方法本实验采用Illumina高通量测序技术构建了唐古特大黄叶绿体全基因组图谱。结果唐古特大黄基因组大小为161054 bp,大(LSC)、小(SSC)单拷贝区大小分别为86441 bp和12745 bp,反向互补重复区(IR)大小为30934 bp,共注释叶绿体基因132个,包括88个蛋白编码基因,36个转运RNA基因和8个核糖体RNA基因,其中每个IR区19个。结论选取唐古特大黄在内的7个蓼科物种、4个其他科物种构建系统发育树,形态极其相似的唐古特大黄与掌叶大黄在分子上亲缘关系也最近,但rpl32等基因存在差异位点,对有效区分近缘物种提供新依据。
关 键 词:蓼科 唐古特大黄 高通量 叶绿体 叶绿体全基因组
分 类 号:R282.12[中药学类]
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