期刊文章详细信息
茶树TCP家族的全基因组鉴定及其表达分析
Genome-Wide Identification,Classification and Expression Analysis of TCP Gene Family in Tea Plant
文献类型:期刊文章
ZHOU Qiying;HAN Yuehua;ZHU Yue;CHEN Sai;LI Xianwen;PENG Bo;YUAN Hongyu(Henan Key Laboratory of Tea Plant Biology,Institute for Conservation and Utilization of Agro-Bioresources in Dabie Mountains,College of Life Sciences,Xinyang Normal University,Xinyang,Henan 464000,China;Business College,Xinyang Normal University,Xinyang,Henan 464000,China)
机构地区:[1]信阳师范学院生命科学学院,河南省茶树生物学重点实验室,大别山农业生物资源保护与利用研究院,河南信阳464000 [2]信阳师范学院商学院,河南信阳464000
基 金:国家自然科学基金项目(U1404319,31270727,U1604110);河南省科技计划项目(182102110449,152102110100);安徽省研究人员科研基金项目(2017B190);南湖青年学者奖励计划项目(2016060);河南省教育厅高等教育教学改革研究与实践项目(2017SJGLX092)
年 份:2019
卷 号:46
期 号:10
起止页码:2021-2036
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:以拟南芥TCP蛋白序列和TCP蛋白保守结构域种子文件(Pfam:03634)检索‘舒茶早’茶树(Camellia sinensis L.)基因组数据库,对茶树TCP基因(CsTCP)进行鉴定,共得到37个基因,分别编码150~607个氨基酸。蛋白质分子量介于16.8~67.6 kD,等电点介于5.10~10.52,内含子数为0~5,其中35个CsTCP定位于细胞核,1个定位于叶绿体,1个在细胞核和叶绿体都有定位。系统发育分析显示,37个CsTCP中,21个属于PCF亚家族,11个属于CIN亚家族,5个属于CYC/TB1亚家族,表明CsTCP家族成员间出现了功能分化。保守基序分析发现,CsTCP蛋白序列中至少存在20个保守基序,同源关系较近的CsTCP成员常具有相似的保守基序构成。亚细胞定位结果显示,CsTCP32定位于细胞核,CsTCP24在细胞核和细胞质都有定位,表明CsTCP蛋白具有转录因子的核定位特征。启动子元件分析发现,CsTCP基因启动子区富含干旱、盐、低温和病原菌侵染胁迫响应元件。基于转录组数据以及半定量和定量PCR分析结果显示,CsTCP基因家族成员在茶树不同组织和胁迫处理后存在差异表达。其中,CsTCP14主要在茎和花中表达,CsTCP32主要在芽和叶中表达;CsTCP19、CsTCP20、CsTCP12和CsTCP32分别在高盐、低温和MeJA处理后上调表达,CsTCP18和CsTCP30在低温和MeJA处理后下调表达。
关 键 词:茶树 TCP 基因家族 表达分析
分 类 号:S571.1]
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