期刊文章详细信息
三峡库区优异稻种资源遗传多样性及群体结构分析
Unlocking the Genetic Diversity and Population Structure of Excellent Rice Germplasm in the Three Gorges Reservoir Area
文献类型:期刊文章
TANG Ru-yu;ZOU Yu-xia;CHEN Jiao;LEI Li-xia;TANG Jiang-hong;GAN Lu;ZHANG Jia-ni;LUO Lan;SHEN Hang;TAI Lin-yu;ZHAO Zheng-wu(College of Life Science,Chongqing Normal University/Chongqing Engineering Research Center of Specialty Crop Resource,Chongqing 401331)
机构地区:[1]重庆师范大学生命科学学院/重庆市特色作物资源工程技术研究中心
基 金:重庆市高校优秀成果转化资助项目(KJZH17114);国家自然科学基金项目(31670326);重庆高校创新团队(CXTDX201601018);重庆市技术创新与应用发展专项(cstc2019jscx-msxm X0353)~~
年 份:2019
卷 号:20
期 号:6
起止页码:1408-1417
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为了阐明三峡库区优异稻种资源的遗传多样性和群体结构,本研究利用25对SSR多态性分子标记对三峡库区不同地理来源和不同类型的81份优异稻种资源进行了遗传多样性和群体结构分析。研究结果显示,上述标记能够高效鉴别参试材料的遗传多样性水平。共检测到56个等位基因,每个位点检测到的等位基因数为2~5,平均为2.44;有效等位基因数变异范围为1.077~2.582,平均为1.757;多态性信息量(PIC)为0.069~0.539,平均为0.332;Shannon信息指数为0.158~1.017,平均为0.625;Nei's基因多样性指数为0.071~0.665,平均为0.407。进一步分析发现,地方品种的平均有效等位基因数高于选育品种,而选育品种的平均等位基因数和Shannon信息指数高于地方品种,两者的基因多样性指数、多态信息含量和期望杂合度极为相近。聚类分析、群体结构分析和主成分分析显示供试材料可分为2个类群,3种分类结果大致相同,各类群聚集的地域性规律不明显,品种的聚类关系较复杂。分子方差分析表明居群间的变异和品种间的变异百分率相当,变异来源于居群间和品种间。
关 键 词:水稻 三峡库区 微卫星标记 遗传多样性 群体结构
分 类 号:S51]
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