文献类型：期刊文章

作　　者：潘贤辉[1] 周康奇[1] 陈忠[1] 杜雪松[1] 黄姻[1] 覃俊奇[1] 文露婷[1] 潘志忠[1] 邓潜[1] 罗辉[2] 叶华[2] 林勇[1]

PAN Xian-hui;ZHOU Kang-qi;CHEN Zhong;DU Xue-song;Huang Yin;QIN Jun-qi;WEN Lu-ting;PAN Zhi-zhong;DENG Qian;LUO Hui;YE Hua;LIN Yong(Guangxi Aquatic Breeding Base,Guangxi Key Laboratory of Aquatic Genetic Breeding and Healthy Aquaculture,Guangxi Academy of Fishery Sciences,Nanning 530021,China;Fisheries Breeding and Health Cultivation Research Center,Southwest University,Chongqing 402460,China)

机构地区：[1]广西壮族自治区水产科学研究院,广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西水产良种南繁基地,南宁530021 [2]西南大学,鱼类繁育与健康养殖研究中心,重庆402460

出　　处：《淡水渔业》

基　　金：广西创新驱动发展专项资金项目(AA17204080-5);自治区主席科技资金项目(16449-0602);广西科技重大专项资金项目(AA17204095-3);国家自然科学基金资助项目(31960730)

年　　份：2019

卷　　号：49

期　　号：6

起止页码：33-40

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：利用线粒体D-loop区和COI基因序列分析了全州禾花鲤(Quanzhou Procypris merus)、融水禾花鲤(Rongshui P.merus)和野生鲤鱼群体的遗传多样性和系统进化关系。基于D-loop区序列分析结果表明:序列长度为927~930 bp,共统计变异位点53个;A、T、G、C核苷酸平均含量分别为33.4%、32.9%、14%和19.7%,A+T(66.3%)明显高于G+C(33.7%);总体的单倍型数(h)、单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为40个、0.95和0.0083;遗传分化指数(Fst)为0.22459。基于COI基因序列分析结果显示:序列长度为897~899 bp,共统计变异位点33个;A、T、G、C核苷酸平均含量分别为26.7%、28.5%、17.8%和27%,且A+T(55.2%)高于G+C(44.8%);总体的h为25个,Hd为0.91,π为0.00316;Fst值为0.19143。在3个群体内和群体间遗传距离分别在0.003~0.009和0.003~0.01,远小于种群分类水平0.05。分子方差分析(AMOVA)结果表明,77.54%(D-loop)和80.86%(COI)变异来自群体间变异,22.46%(D-loop)和19.14%(COI)来自群体内变异。单倍型进化树和网络图显示,全州禾花鲤和野鲤群体均存在单独聚为一支的单倍型,而融水群体未出现单独成支现象。研究表明,线粒体D-loop区作为反映3个群体间遗传多样性的灵敏度要高于COI基因,并且3个群体均属于高单倍型多样性和高核苷酸多样性。综上,3个群体间出现了较为明显的分化现象。

关 键 词：线粒体DNA 禾花鲤(Procypris  merus)  遗传多样性  系统进化

分 类 号：S917.4[水产类]