文献类型：期刊文章

作　　者：宋启飞[1] 戴仲秋[1] 杜宝中[2] 李梦娇[1] 巫丽娟[1] 刘敏雪[1] 熊丽[1] 谢轶[1]

SONG Qi-fei;DAI Zhong-qiu;DU Bao-zhong;LI Meng-jiao;WU Li-juan;LIU Min-xue;XIONG Li;XIE Yi(Department of Laboratory Medicine,West China Hospital,Sichuan University,Chengdu 610041,China;Department of Pathogenic Biology,Medical College of Tibet University,Lhasa 850000,China)

机构地区：[1]四川大学华西医院实验医学科,成都610041 [2]西藏大学医学院病原生物学教研室,拉萨850000

出　　处：《四川大学学报（医学版）》

年　　份：2019

卷　　号：50

期　　号：6

起止页码：872-877

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的研究结核分枝杆菌复合体(Mycobacterium tuberculosis complex, MTBC)数目可变串联重复序列(variable number tandem repeat, VNTR)重复单位拷贝数与菌株蛋白质谱差异的关系。方法采用多位点数目可变串联重复序列分析(multiple locus variable number tandem repeat analysis, MLVA)对MTBC进行基因分型。同时,利用基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser-desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)对菌株的蛋白质谱进行主成分分析(principal components analysis,PCA),分析VNTR位点重复单位拷贝数差异(多态性)与菌株PCA聚类的关系。结果共收集157株MTBC菌株。146株MTBC(质谱鉴定得分≥1.700)生成的PCA树状图分为3个群,分别为Ⅰ群(61株)、Ⅱ群(26株)和Ⅲ群(59株)。24个VNTR位点多态性存在差异,其中7个高、7个中等和10个低多态性。MTBC菌株的Mtub39、QUB26、QUB4156位点多态性与菌株MALDI-TOF MS聚类有关(P=0.000,P=0.035,P=0.017)。结论 MTBC菌株的Mtub39、QUB26、QUB4156位点多态性与菌株蛋白质谱的差异有关,3个位点可能具有调控菌株蛋白质谱构成的作用。

关 键 词：结核分枝杆菌复合体  数目可变串联重复序列 MALDI-TOF MS 主成分分析 多态性

分 类 号：R44]